在自家楼顶搭棚子是否算违建，以及是否会被城管拆除，关键在于是否依法取得了相关许可，并符合城乡规划及建筑规范。以下是对此问题的详细分析：
属于违建的情况
未经许可搭建：
- 在城市规划区内，任何搭建行为，包括在自家楼顶搭棚子，均需依法取得建设工程规划许可证或其他相关许可。若未取得许可证或未按许可证规定进行建设，该搭建行为将被视为违建。例如，若您未向相关部门申请并获得批准，就在楼顶随意搭建了一个用于储物的棚子，这很可能构成违建。
不符合规划要求：
- 即使取得了某种许可，但搭建的棚子在位置、高度、面积等方面若不符合城乡规划的具体要求，如建筑退让道路红线、建筑高度限制等，同样会被认定为违建。比如，若规划要求楼顶不得搭建任何构筑物，或搭建的棚子高度超过了规定限制，那么您的搭建行为就可能违法。
在禁止建设区域搭建：
- 在某些特定区域，如河道管理范围、城市公共绿地、文物保护范围等，通常禁止未经允许的建筑物、构筑物搭建。若在这些区域搭棚，无论是否有审批手续，一般都属于违建。不过，这种情况在自家楼顶搭棚子时较为少见，但仍需注意所在区域是否有特殊规定。
超过临时建设期限未拆除：
- 若您搭建的棚子属于临时性建筑，如因建设工程施工、地质勘查等需要而搭建的临时工棚，且超过了批准的使用期限未拆除，那么该棚子也将被视为违建。
不属于违建的情况
- 合法审批后搭建：
- 若您按照法定程序向当地规划、建设等相关部门提出搭建申请，并经过审核批准，获得了合法的建设手续，且按照批准的设计方案和要求进行搭建，则此搭棚行为合法，不属于违建。例如，若您因特殊需求（如安装太阳能设备、遮阳等）向相关部门申请并获得了批准，在楼顶搭建了一个符合规定的棚子，那么该棚子就是合法的。
报备与合法搭建的建议
咨询相关部门：
- 在搭建棚子之前，务必咨询当地规划、建设等相关部门，了解具体的规划、建筑规定及审批流程。这可以帮助您避免不必要的法律纠纷和经济损失。
准备相关材料：
- 根据相关部门的要求，准备搭建申请所需的材料，如身份证明、房产证明、搭建设计方案等。确保材料的真实性和完整性，以便顺利通过审批。
按照批准要求搭建：
- 若获得了合法的建设手续，务必按照批准的设计方案和要求进行搭建。不得擅自改变搭建位置、高度、面积等关键参数，以免构成违建。
可能的法律后果
若构成违建：
- 若您的搭建行为被认定为违建，城管部门有权依法进行拆除，并可能对您处以罚款等行政处罚。此外，违建还可能影响您的房产价值、邻里关系等。
若合法搭建：
- 若您的搭建行为合法合规，则无需担心被拆除或处罚的问题。您可以安心使用搭建的棚子，满足自己的特殊需求。
综上所述，在自家楼顶搭棚子是否算违建，以及是否会被城管拆除，取决于您是否依法取得了相关许可，并符合城乡规划及建筑规范。为了确保搭建行为的合法性，建议您在搭建前咨询相关部门，了解具体的规定和审批流程，并按照批准要求进行搭建。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。