故意毁坏庄稼的立案标准主要依据毁坏财物的价值、毁坏次数、手段及社会影响等因素综合判断，具体如下：

1. 财物价值标准
   根据《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（一）》第三十三条，故意毁坏公私财物，造成财物损失达到5000元以上的，应当立案追诉。

   • 实践中，庄稼的价值通常按市场价格或评估机构出具的鉴定意见计算，包括种子、肥料、人工等成本及预期收益。
     
   • 若毁坏的是珍贵农作物（如科研用种、濒危植物），即使价值未达5000元，也可能因社会危害性较大被立案。

2. 毁坏次数与手段

   • 多次毁坏：毁坏庄稼3次以上的，即使单次价值未达标准，也可能被认定为“情节严重”而立案。
     
   • 手段恶劣：如使用焚烧、投毒、挖掘等破坏性手段，或针对特定对象（如贫困户、农业合作社）实施毁坏，可能降低立案门槛。

3. 社会影响与后果

   • 若毁坏行为导致大面积农田绝收、引发群体性事件或影响粮食安全，即使财物价值未达标准，公安机关也可能以“社会危害性较大”为由立案。
     
   • 例如，毁坏基本农田或国家重点保护农业项目中的庄稼，可能涉及更严重的刑事责任。

补充说明：

• 若毁坏财物价值未达刑事标准，行为人可能面临《治安管理处罚法》第四十九条的处罚，处5-15日拘留，可并处1000元以下罚款。
  
• 受害方可要求行为人赔偿直接损失（如庄稼价值）及间接损失（如预期收益），赔偿数额可通过协商、调解或民事诉讼确定。
  

建议：若您遇到庄稼被毁坏的情况，首先固定证据（如现场照片、视频、证人证言），及时报警并申请对损失价值进行鉴定。如有疑问，可直接向我咨询具体法律程序。