针对快递公司违规诬陷对方是恶意投诉的情况，你可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
收集证据：
- 首先，要尽可能收集所有与快递公司诬陷行为相关的证据。这包括但不限于快递公司的投诉记录、诬陷的书面或电子证据（如短信、邮件、聊天记录等）、与快递公司沟通的录音或录像等。
- 证据是维权的基础，务必确保收集的证据真实、完整且合法有效。
与快递公司沟通：
- 在收集到足够证据后，可以尝试与快递公司进行沟通，明确指出其诬陷行为，并要求其立即停止侵权行为，公开道歉并消除影响。
- 沟通时，建议保持冷静和理性，以事实为依据，避免情绪化的表达。
向相关部门投诉：
- 如果与快递公司的沟通无果，或者快递公司拒绝承认其诬陷行为，你可以向当地的邮政管理部门或消费者协会进行投诉。
- 投诉时，需要提供详细的证据和情况说明，以便相关部门能够准确了解事情经过，并作出相应的处理。
考虑法律途径：
- 如果上述措施均未能解决问题，你可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。这包括向法院提起诉讼，要求快递公司承担侵权责任，包括赔偿损失、公开道歉等。
- 在提起诉讼前，建议咨询专业律师，了解具体的法律程序和可能面临的法律风险。
关注法律后果：
- 快递公司诬陷他人恶意投诉，可能构成对他人名誉权的侵害，需要承担相应的法律责任。这包括民事赔偿、行政处罚等。
- 如果快递公司的行为情节严重，还可能构成诽谤罪等刑事犯罪，需要承担刑事责任。
在处理此类问题时，还需要注意以下几点：
- 保持冷静：面对快递公司的诬陷行为，保持冷静和理性至关重要。避免情绪化的反应，以免加剧矛盾或影响维权效果。
- 及时行动：一旦发现快递公司存在诬陷行为，应尽快采取行动，收集证据并与快递公司沟通。拖延时间可能导致证据丢失或维权难度增加。
- 寻求专业帮助：如果对法律程序不熟悉或感到困惑，可以寻求专业律师的帮助。律师能够提供专业的法律意见和指导，帮助你更好地维护自己的权益。
最后，我想强调的是，每个人的合法权益都应得到尊重和保护。面对快递公司的违规诬陷行为，你有权采取必要的措施来维护自己的名誉和权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。