结论：工伤劳动能力鉴定后医嘱康复和后期检查为两年，后期康复费和检查费用能否报销及报销方式需分情况讨论，具体如下：

1. 若单位已为员工缴纳工伤保险

   • 费用承担主体：根据《工伤保险条例》规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病进行治疗，享受工伤医疗待遇。治疗工伤所需费用符合工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准的，从工伤保险基金支付。所以，在医嘱规定的两年内的合理康复费和检查费用，一般由工伤保险基金承担。
   • 报销流程：员工需要先到签订服务协议的医疗机构进行工伤康复和检查，并保存好相关的费用发票、诊断证明、病历等材料。然后，由单位携带这些材料以及工伤认定决定书、劳动能力鉴定结论等，到社会保险经办机构申请报销。经办机构会对提交的材料进行审核，审核通过后，将符合规定的费用支付给单位或者员工。
   • 特殊情况：如果员工需要到统筹地区以外就医进行康复和检查，需经医疗机构出具证明，报经办机构同意。此时，相关的交通、食宿费用也按照规定从工伤保险基金支付。

2. 若单位未为员工缴纳工伤保险

   • 费用承担主体：依据《工伤保险条例》第六十二条，依照本条例规定应当参加工伤保险而未参加工伤保险的用人单位职工发生工伤的，由该用人单位按照本条例规定的工伤保险待遇项目和标准支付费用。因此，这种情况下，后期康复费和检查费用由用人单位承担。
   • 支付方式：员工可以与用人单位协商支付方式和时间。如果协商不成，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求用人单位支付相关费用。对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院提起诉讼。

3. 关于费用的合理性认定

   • 无论是工伤保险基金支付还是用人单位承担，康复费和检查费用都必须是合理的、必要的。如果费用过高或者存在不合理的治疗项目，社会保险经办机构或者用人单位有权拒绝支付。例如，一些非必要的进口药品、高端的检查设备使用等，可能不会被认定为合理费用。
   • 在实际处理中，对于费用的合理性可能会存在争议。此时，可能需要通过专业的医疗鉴定机构进行鉴定，以确定费用是否符合工伤治疗的需要。