小贷公司因非法吸收公众存款收到公诉书后，收回的钱一般会按以下原则处理：

1. 优先退赔集资参与人
   根据《防范和处置非法集资条例》第二十五条，非法吸收的资金应优先用于退赔集资参与人。具体流程为：司法机关会委托第三方机构（如会计师事务所）对涉案资金进行审计，明确每名集资参与人的本金损失金额，然后按比例退赔。例如，若公司吸收了1000万元，实际收回800万元，而集资参与人总损失为900万元，则退赔比例为800/900≈88.9%，即每名参与人可拿回其损失金额的88.9%。

2. 剩余资金上缴国库
   若退赔后仍有剩余资金（如公司吸收1000万元，收回1200万元，退赔900万元后剩余300万元），这部分资金会作为违法所得上缴国库。根据《刑法》第六十四条，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。没收的财物和罚金，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。

3. 特殊情形下的处理规则

   • 员工工资与运营成本：若公司用非法吸收的资金支付员工工资、房租等运营成本，这些支出通常不被认定为“合法支出”，不会从退赔资金中扣除。但司法实践中，若员工能证明其不知情且未参与非法活动，可能通过劳动仲裁另行主张工资。
     
   • 第三方合作方款项：若公司将部分资金支付给第三方（如广告商、技术服务商），需区分第三方是否善意。若第三方明知或应知公司非法集资仍提供服务，其收取的款项可能被追缴；若第三方无过错，则款项不受影响。
     
   • 抵押物处置：若公司以房产、车辆等资产抵押借款，司法机关会先通过拍卖、变卖等方式变现资产，所得款项纳入退赔资金池，按上述规则分配。

给小贷公司及相关人员的建议：

• 若你是公司实际控制人或高管，应主动配合司法机关调查，如实说明资金流向，避免因隐瞒或转移资产被追究更重的刑事责任（如集资诈骗罪）。
  
• 若你是集资参与人，需及时向司法机关登记损失金额，并提供转账记录、合同等证据，以便后续退赔。
  
• 若你是员工，若未参与非法活动，可保留工资条、劳动合同等证据，通过劳动仲裁主张工资；若参与非法活动，可能面临刑事追责，建议尽早委托律师介入。
  

如有其他细节需要进一步分析（如资金流向、人员参与程度等），可以直接向我咨询，我会结合具体案情为你详细解答。