父子之间写的协议，在符合法定条件时是有效的。以下从多个角度为您详细分析：
一、协议有效的基本条件
行为人具有相应的民事行为能力：
- 签订协议的父子双方必须具备完全民事行为能力，能够独立进行民事活动并承担民事责任。如果一方或双方为无民事行为能力人（如未成年人或精神病人）或限制民事行为能力人，则协议可能因主体不适格而无效。
意思表示真实：
- 协议的内容必须是双方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫等情形。如果协议是在一方被欺诈、胁迫的情况下签订的，受损害方有权请求撤销该协议。例如，父亲在受到儿子威胁的情况下签订了财产分割协议，父亲可以在知道撤销事由之日起一年内请求法院撤销该协议。
不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗：
- 协议的内容必须合法合规，不得违反国家法律法规的强制性规定，也不得违背社会公德和公共秩序。例如，协议中不得包含违法分配财产、逃避债务、侵犯他人合法权益等内容。
二、协议有效的特殊情形与注意事项
共同共有财产的分割：
- 如果父子双方共同拥有财产（如家庭共有财产），在协商一致的基础上可以订立分割协议。但需注意，这种分割不得损害其他共有人的合法权益。例如，家庭共有财产中还包括母亲的份额，那么父子在分割时就不能损害母亲的权益。
- 对于按份共有的财产，共有人可以随时请求分割，但同样需要遵循法律规定和协议约定。
赠与合同的特殊性：
- 如果协议涉及赠与行为（如父亲将财产赠予儿子），则赠与人在财产权利转移之前可以撤销赠与（除非经过公证或具有救灾、扶贫等社会公益、道德义务性质）。例如，父亲与儿子签订了房屋赠与协议，但未办理过户手续，父亲在房屋过户前可以撤销赠与。
- 赠与合同一旦履行完毕（即财产权利已转移），则不可任意撤销。例如，房屋已经过户到儿子名下，父亲就不能再随意撤销赠与。
遗嘱与生前协议的区分：
- 遗嘱是立遗嘱人在生前对死后财产分配的单方法律行为，其效力始于立遗嘱人死亡之时。而父子财产分割协议是双方生前的合意行为，其效力始于协议成立之时。
- 若存在多份内容冲突的遗嘱或协议，需根据法律规定确定最终效力（如后立遗嘱优先于先立遗嘱，但公正遗嘱效力更高）。
形式要件要求：
- 根据《中华人民共和国民法典》相关规定，部分财产处分行为（如不动产赠与）需办理登记手续才能生效。未满足形式要件的协议可能存在效力瑕疵。例如，父子签订了房屋赠与协议，但未办理过户手续，该协议在房屋过户前可能不产生法律效力。
三、协议无效的常见情形
恶意串通损害他人权益：
- 如果协议双方恶意串通，损害国家、集体或第三人利益，则该协议无效。例如，父子为了逃避债务而签订虚假财产分割协议，将财产全部转移到儿子名下，该协议可能因恶意串通损害债权人利益而无效。
以虚假意思表示订立的合同：
- 如果协议双方以虚假的意思表示订立合同，则该合同无效。但需注意，如果存在隐藏的真实法律关系且该关系合法有效，则可能按照实际履行的内容确认效力。例如，父子为了某种目的而签订了虚假买卖合同，但实际上并没有买卖的意图和行为，该合同可能因虚假意思表示而无效。
建议：在签订父子协议时，务必确保双方具备完全民事行为能力、意思表示真实、协议内容合法合规，并尽可能办理相关登记手续以确保协议效力。如果涉及复杂财产分割或赠与行为，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议。您有任何具体的法律问题，都可以直接向我咨询。