结论：新房交付时三个单元只有一个单元门是否合法，需结合具体情况判断，包括规划审批、合同约定及实际使用需求等因素。以下从不同角度详细分析：

1. 规划审批角度

• 合法情形：若开发商在规划审批阶段明确申报并获批的建筑设计方案中，三个单元仅设计一个单元门（例如因地形限制、消防通道整合或设计优化等原因），且该方案已通过规划部门审核并公示，则交付时仅有一个单元门属于合法情形。
• 违法情形：若规划审批文件中明确要求三个单元需分别设置单元门，但开发商擅自修改设计未重新报批，或未通过规划变更程序，则交付时仅有一个单元门属于违法行为，业主可向规划部门投诉或要求整改。

2. 合同约定角度

• 合同明确约定：若购房合同中明确约定“房屋交付时三个单元分别设置独立单元门”，但实际交付时仅有一个单元门，则开发商构成违约，业主可依据合同要求开发商承担违约责任（如整改、赔偿损失等）。
• 合同未明确约定：若合同未对单元门数量作出具体约定，则需结合规划审批文件及行业惯例判断。若规划审批文件支持单门设计，且开发商能证明单门设计符合消防、安全等强制性标准，则可能不构成违约。

3. 实际使用需求角度

• 合理性审查：即使规划审批和合同均未明确禁止单门设计，若单门设计导致业主实际使用不便（如高峰时段拥堵、安全隐患增加等），业主仍可要求开发商优化设计（如增设侧门、拓宽通道等）。
• 消防安全标准：根据《建筑设计防火规范》，单元门需满足消防疏散要求。若单门设计导致疏散宽度不足或疏散路径过长，则可能违反消防法规，业主可向消防部门举报并要求整改。

4. 法律后果与建议

• 业主权利：若开发商行为违法或违约，业主可采取以下措施：
  1. 协商解决：与开发商沟通，要求其限期整改或赔偿损失；
  2. 行政投诉：向规划、消防等部门举报开发商的违法行为；
  3. 民事诉讼：依据合同或法律规定，向法院起诉开发商承担违约责任或侵权责任。
• 开发商义务：开发商需确保交付的房屋符合规划审批要求、合同约定及强制性标准，否则需承担相应的法律责任。

温馨提示：若您遇到此类问题，建议首先核查购房合同及规划审批文件，明确单元门数量的约定及审批要求；若存在争议，可收集相关证据（如照片、视频、合同条款等）并咨询专业律师，以便进一步维护自身权益。