核心结论：三万元公款私用治病，两年后主动退还，这一行为仍可能涉及违法甚至犯罪，但主动退还可作为从轻或减轻处罚的情节。具体处理方式需结合公款性质、使用方式及后果等因素综合判断。以下分情况详细说明：

1. 若公款属于国家机关、国有企事业单位或集体所有资金

• 可能涉嫌的罪名：根据《刑法》第384条，若行为人属于国家工作人员（如公务员、国企管理人员等），私用公款可能构成挪用公款罪。即使两年后主动退还，仍需承担刑事责任，但退还行为可作为量刑时的从轻情节。
• 量刑标准：挪用公款数额较大（一般3万元以上）进行营利活动或超过三个月未还的，处五年以下有期徒刑或拘役；情节严重的（如数额巨大、多次挪用等），处五年以上有期徒刑。主动退还可能减少基准刑的30%以下。
• 例外情形：若公款用于个人治病且未谋取私利，可能被认定为“挪用公款进行非法活动”以外的情形，量刑相对较轻，但仍需承担责任。

2. 若公款属于公司、企业或其他非国有单位资金

• 可能涉嫌的罪名：根据《刑法》第272条，若行为人属于公司、企业工作人员（如私企员工、财务人员等），私用公款可能构成挪用资金罪。同样，退还行为可作为从轻情节。
• 量刑标准：挪用资金数额较大（一般6万元以上）或进行营利活动、非法活动的，处三年以下有期徒刑或拘役；数额巨大或情节严重的，处三年以上十年以下有期徒刑。主动退还可能减少基准刑的20%-30%。
• 民事责任：即使不构成犯罪，行为人仍需承担民事赔偿责任，即返还公款并可能赔偿单位因此遭受的损失（如利息、维权费用等）。

3. 关键情节对处理结果的影响

• 主动退还的时间与态度：两年后主动退还，虽不如及时退还更能体现悔罪态度，但仍优于拒不退还。若退还时配合调查、如实供述，可进一步争取从宽处理。
• 公款用途与后果：若治病导致公款长期无法归还或单位资金周转困难，可能加重责任；若未造成实际损失，量刑时可能酌情从轻。
• 行为人身份与职务：国家工作人员的处罚通常严于非国家工作人员；管理人员或财务人员的责任可能重于普通员工。

4. 建议处理步骤

• 自查与取证：整理公款使用记录、退还凭证、医疗证明等材料，证明资金用途及退还情况。
• 主动说明情况：向单位或相关部门（如纪委、公安机关）如实陈述事实，表达悔罪态度，争取内部处理或从宽建议。
• 咨询专业律师：根据案件性质（刑事或民事）、身份及证据情况，制定辩护策略或赔偿方案，避免因程序失误加重责任。

总结：公款私用治病即使主动退还，仍可能面临刑事或民事责任，但退还行为是重要的从轻情节。建议尽快采取上述步骤，最大限度降低法律风险。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体细节。