在基本农田上建设养殖场并使其合法化，需要遵循一系列法律法规和程序。以下是一个清晰、详细且有深度的解答：
一、了解基本农田保护政策
首先，必须明确基本农田是受到严格保护的，一般不允许随意改变其用途。然而，根据《中华人民共和国畜牧法》的相关规定，畜禽养殖用地按照农业用地管理，且各级人民政府应当保障畜禽养殖用地合理需求。这意味着，在符合一定条件下，基本农田可以用于畜禽养殖，但需遵循特定程序。
二、选址与规划
选址要求：
- 养殖场必须选在畜禽养殖禁养区以外。
- 选址应符合国土空间规划，并考虑对周边环境的影响，特别是与居民生活区、生活饮用水水源地、学校、医院等公共场所的距离需符合国务院农业农村主管部门的规定。
规划审批：
- 在选定场地后，需要向当地县级国土空间规划部门咨询并申请用地规划许可，确保养殖场建设符合当地土地利用总体规划。
三、办理相关手续
土地使用权手续：
- 取得合法的土地使用权是建设养殖场的前提。这通常涉及与土地所有者（如村集体）签订土地租赁或承包合同，并办理相关土地登记手续。
环保手续：
- 养殖场建设需符合环保要求，包括污水、污物处理，病死动物无害化处理等。因此，需要向当地环保部门申请环保评估，并办理环保审批手续。
动物防疫条件合格证：
- 根据《中华人民共和国动物防疫法》的规定，新建畜禽养殖场需向属地县级人民政府农业农村部门提出申请，并取得《动物防疫条件合格证》。这要求养殖场具备符合规定的场所位置、封闭隔离的生产经营区域、完善的动物防疫设施和制度等。
四、建设与管理
建设要求：
- 在畜禽养殖用地范围内兴建永久性建（构）筑物，若涉及农用地转用的，需依照《中华人民共和国土地管理法》的规定办理农用地转用审批手续。
- 养殖场建设应符合相关建筑规范和安全标准，确保养殖活动的顺利进行和人员安全。
后续管理：
- 养殖场建成后，需按照相关法律法规和规章制度进行管理，包括动物防疫、环境保护、安全生产等方面。
- 定期接受相关部门的检查和监督，确保养殖活动的合法性和规范性。
五、注意事项
- 在整个过程中，务必保持与当地政府和相关部门的密切沟通，确保每一步都符合法律法规和政策要求。
- 养殖场建设是一个复杂的过程，涉及多个部门和环节，因此建议寻求专业咨询或委托专业机构进行办理，以提高效率和准确性。
综上所述，在基本农田上建设养殖场并使其合法化需要遵循一系列法律法规和程序。通过合理选址、规划审批、办理相关手续以及严格的建设与管理，可以确保养殖场的合法性和规范性。