您好，关于子女抚养权变更协议的办理部门，这主要取决于您选择的处理方式。一般来说，变更子女抚养权有两种主要方法：

方法一：协商一致并公证

如果您和对方能够就子女抚养权的变更达成一致意见，那么你们可以共同制定一份《子女抚养权变更协议》。这份协议在双方签字确认后，为了增强其法律效力，可以选择到当地的公证处进行公证。公证处会对协议的真实性、合法性进行审查，并出具公证书。这样，协议就具有了更强的法律保障。

公证处选择：

• 您可以选择就近的公证处进行办理，比如北京市的方圆公证处、长安公证处等，具体地址和联系方式可以在相关官方网站或电话咨询中获取。

方法二：通过法院诉讼变更

如果双方无法就子女抚养权的变更达成一致意见，或者存在争议，那么您可以选择向法院提起诉讼，由法院根据双方的实际情况和子女的利益来判决是否变更抚养权。在这种情况下，您需要准备相关的证据材料，如子女的生活状况、双方的抚养能力等，以支持您的诉求。

法院选择：

• 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，变更抚养权案件的管辖法院应该为被监护人（即子女）住所地人民法院。因此，您需要向子女住所地的人民法院提起诉讼。

具体流程：

1. 协商一致并公证：

   • 双方签订《子女抚养权变更协议》。
   • 携带协议及相关证件到公证处申请公证。
   • 公证处审查并出具公证书。

2. 通过法院诉讼变更：

   • 准备相关证据材料。
   • 向子女住所地的人民法院提起诉讼。
   • 法院审理并作出判决。

注意事项：

• 在处理子女抚养权变更问题时，请务必以子女的利益为出发点，确保子女的身心健康和成长环境。
• 如果双方能够协商一致，那么通过公证的方式处理会更加简便和快捷。
• 如果无法协商一致，那么请及时寻求法律援助或咨询专业律师，以确保您的权益得到保障。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。