结论前置：自离和辞职对工资的影响程度取决于具体情况，但通常来说，自离可能对工资的影响更大且更复杂，尤其是在未按照法定程序办理离职手续的情况下。以下从不同角度详细分析：
一、自离对工资的影响
工资结算风险：
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条及《工资支付暂行规定》第九条，劳动者提供正常劳动后，用人单位应按月支付工资，且在劳动关系解除或终止时，应一次付清劳动者工资。然而，自离行为可能违反劳动合同或公司规章制度，导致用人单位以“旷工”或“违反公司规定”为由扣除部分工资。
- 实际操作：若自离给用人单位造成直接经济损失（如岗位空缺导致的额外招聘成本、商业秘密泄露等），用人单位可能依据《工资支付暂行规定》第十六条，从工资中扣除赔偿，但每月扣除部分不得超过当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。但需注意，这种扣除通常针对自离当月的工资，而非上月工资。不过，若公司规章制度或劳动合同中明确规定自离需扣发上月工资，且该规定合法有效，则可能影响上月工资发放。
社保和公积金中断：
- 自离后，社保和公积金通常会停缴，若未及时办理相关手续，可能导致缴费混乱。虽然这不直接影响工资数额，但可能影响医保报销、公积金贷款等权益，间接增加经济负担。
再就业风险：
- 自离可能导致难以获得原单位的离职证明，新单位在招聘时通常要求此证明以确认工作经历和劳动关系解除情况。缺乏离职证明可能引发新单位对求职者诚信和职业素养的怀疑，影响录用决策，进而影响未来收入。
二、辞职对工资的影响
工资结算保障：
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。辞职时，只要劳动者按照法定程序办理离职手续，用人单位应依法支付全部工资，包括上月工资和当月已工作部分的工资。
- 实际操作：辞职时，劳动者通常能与公司协商确定离职日期和工资结算方式，避免因自离导致的工资纠纷。
经济补偿可能性：
- 若用人单位存在过错（如未及时支付劳动报酬、未依法缴纳社会保险等），劳动者依据《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条辞职时，有权要求用人单位支付经济补偿。经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。
社保和公积金转移：
- 辞职时，劳动者可依法办理社保和公积金转移手续，确保权益连续性，避免因中断导致的损失。
三、综合建议
优先选择辞职：
- 若劳动者希望保障工资权益、避免法律风险，建议优先选择辞职方式离职，并按照法定程序办理离职手续。
自离前的准备：
- 若因特殊原因必须自离，建议提前与公司沟通，了解公司规章制度和劳动合同中关于自离的规定，尽量减少对工资的影响。同时，保留好工作记录、工资条等证据，以备维权之需。
维权途径：
- 若用人单位以自离为由克扣工资或拒绝支付，劳动者可先尝试与公司协商解决；协商不成的，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
总结：自离和辞职对工资的影响程度取决于具体情况，但自离通常伴随更大的风险和不确定性。为保障自身权益，建议劳动者在离职前充分了解法律规定和公司政策，选择合法合规的离职方式。如有任何疑问或需要进一步帮助，请随时向我咨询。