支付工资是否需要付款申请单，需分情况讨论：

1. 企业有明确财务制度或劳动合同约定时
   若企业通过规章制度或与员工签订的劳动合同中明确约定“支付工资需提交付款申请单”，则企业有权要求员工配合完成申请流程。此时，付款申请单属于企业内部管理要求，具有合同约束力。但需注意：

   • 制度或合同条款不得违反《劳动法》《劳动合同法》中关于“工资必须以货币形式按月支付给劳动者本人”的强制性规定；
     
   • 若员工因客观原因（如突发疾病、出差等）无法及时提交申请单，企业不得以此为由拒绝支付工资，否则可能构成拖欠工资。

2. 企业无明确规定或劳动合同未约定时
   根据《工资支付暂行规定》第七条，企业只需在约定时间、以约定方式（如银行转账、现金等）足额支付工资即可，无需强制要求员工提交付款申请单。若企业单方面强制要求，可能涉及以下风险：

   • 侵犯劳动者合法权益：员工有权拒绝无合理依据的额外流程；
     
   • 行政处罚风险：若因未及时支付工资引发劳动争议，劳动监察部门可责令企业限期支付，并可能加付赔偿金。

3. 特殊场景下的变通处理

   • 离职员工工资结算：部分企业会要求离职员工填写《离职工资结算单》，明确工资构成、扣除项及实发金额，这属于合理流程，但需员工签字确认；
     
   • 代发工资情形：若企业委托第三方代发工资（如通过人力资源公司），可能需员工提供银行卡信息等材料，但无需单独提交“付款申请单”。

建议：

• 对企业：若需规范流程，建议通过民主程序制定《工资支付管理制度》，明确申请单的提交要求、例外情形及违约责任，并确保制度内容合法合规；
  
• 对员工：若企业无合理理由拒绝支付工资，可保留考勤记录、工资条等证据，向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
  

如有具体场景需进一步分析，欢迎随时向我咨询。