结论：是否可以对不服从公司安排且和甲方不认可的施工队进行清场，需视具体情况而定，包括施工队的合同地位、不服从安排的具体原因及后果、以及相关法律法规和合同条款的约定。以下从不同角度进行分析：
合同地位与约定：
- 如果施工队是公司直接雇佣或签订合同的，且合同中明确规定了施工队需服从公司的安排，以及甲方对施工队的认可权，那么在施工队不服从安排且甲方不认可的情况下，公司有权依据合同条款对施工队进行清场。
- 如果施工队并非公司直接雇佣，而是通过分包、转包等方式进入项目现场，那么公司清场的权利可能受到分包合同或转包合同的限制。此时，公司需先审查相关合同条款，确定自身权利范围。
不服从安排的具体原因及后果：
- 如果施工队的不服从安排是由于公司的不合理要求或违法行为导致的，那么施工队有权拒绝执行，并可能因此免除被清场的责任。
- 如果施工队的不服从安排是无正当理由的，且已经对项目进度、质量或安全造成了严重影响，那么公司有权依据合同条款或相关法律法规对施工队进行清场，并可能要求施工队承担相应的违约责任。
相关法律法规的适用：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，雇主与雇员之间应建立合法、公平、和谐的劳动关系。如果施工队作为雇员不服从公司的合法安排，公司有权采取相应的管理措施，包括清场。但需注意，清场行为必须合法、合理，且不得侵犯施工队的合法权益。
- 如果施工队并非公司雇员，而是作为独立的承包商或分包商参与项目，那么公司清场的权利可能受到《中华人民共和国合同法》等相关法律法规的约束。此时，公司需确保清场行为符合合同约定和法律规定，避免引发法律纠纷。
实际操作建议：
- 在决定对施工队进行清场前，公司应先与施工队进行充分沟通，了解其不服从安排的具体原因，并尝试通过协商解决问题。
- 如果协商无果，公司应审查相关合同条款和法律法规，确定自身权利范围，并制定合理的清场方案。
- 在清场过程中，公司应确保行为合法、合理，避免侵犯施工队的合法权益。同时，公司应做好相关证据的收集和保存工作，以备不时之需。
进一步思考：在实际操作中，公司还需考虑清场可能带来的法律后果和成本。例如，清场可能导致项目进度延误、质量下降或安全风险增加等后果，公司需对此进行充分评估并制定相应的应对措施。此外，如果清场行为引发法律纠纷，公司还需承担相应的诉讼成本和风险。因此，在决定对施工队进行清场前，公司应谨慎权衡利弊并咨询专业律师的意见。
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