妈妈与女儿当然可以进行亲子鉴定。亲子鉴定是一种通过科学手段来确定亲子关系的方法，它并不受限于父母与子女的性别或关系类型，无论是父子、母子还是母女之间，都可以进行亲子鉴定来确认亲子关系。

亲子鉴定的法律依据与科学性

亲子鉴定主要依赖于DNA分析技术，这是一种高度准确且可靠的科学方法。在法律上，亲子鉴定结果通常被视为具有法律效力的证据，可以用于解决亲子关系争议、继承权确认、抚养权纠纷等多种法律问题。

亲子鉴定的适用场景

1. 确认亲子关系：当妈妈与女儿之间对亲子关系存在疑问或争议时，可以通过亲子鉴定来明确关系。
2. 法律诉讼：在涉及抚养权、继承权等法律纠纷中，亲子鉴定结果可以作为重要证据来支持或反驳某方的主张。
3. 个人需求：有些人可能出于个人原因，如寻找失散多年的亲人、确认自己的生物身份等，也会选择进行亲子鉴定。

亲子鉴定的流程与注意事项

1. 选择正规机构：进行亲子鉴定时，应选择具有合法资质和良好信誉的鉴定机构，以确保鉴定结果的准确性和法律效力。
2. 提供样本：通常需要提供妈妈与女儿的血液、口腔拭子或其他生物样本进行DNA分析。
3. 保护隐私：亲子鉴定涉及个人隐私，鉴定机构应严格保密鉴定过程和结果，确保当事人的隐私权不受侵犯。
4. 理解结果：亲子鉴定结果通常以概率形式表示，如“99.99%的亲子关系概率”。当事人应正确理解这一结果，避免误解或过度解读。

特殊情况下的考虑

在某些特殊情况下，如妈妈与女儿之间存在法律纠纷或争议，且一方拒绝配合进行亲子鉴定时，另一方可以通过法律途径申请强制鉴定。但这种情况需要具体分析，并遵循相关法律程序。

总结与建议：妈妈与女儿之间可以进行亲子鉴定，这是一种科学、准确且可靠的方法来确认亲子关系。如果你或你的家人有这方面的需求或疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议和帮助。