结论：借条中约定1000元日利息40元，这一利率水平不合法，且远超法律保护的利率上限。

法律背景与利率计算

根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》，民间借贷的利率受到严格限制，以防止高利贷等不法行为。具体来说：

• 利率上限：借贷双方约定的利率未超过合同成立时一年期贷款市场报价利率（LPR）的四倍，受法律保护。超出此限度的，超出部分的利息不予保护。

• 日利率计算：以当前一年期LPR（假设为3.45%，实际数值可能随时间变化）为例，其四倍为13.8%。换算成日利率，即\(13.8\% \div 365 \approx 0.0378\%\)（年利率换算为日利率的公式为：日利率=年利率/365）。这意味着，对于1000元的借款，每日合法利息应不超过\(1000元 \times 0.0378\% \approx 0.378元\)。

• 对比用户情况：用户问题中提到的日利息为40元，这相当于年利率高达\(40元 \div 1000元 \times 365 = 14600\%\)，远超法律保护的利率上限。

法律后果与建议

1. 超出部分无效：借条中约定的超出法律保护利率上限的利息部分，将不被法院认可和支持。借款人只需偿还本金及合法范围内的利息。

2. 风险警示：高利贷不仅违法，而且可能导致借款人陷入严重的经济困境，甚至引发一系列社会问题。因此，建议借贷双方在约定利率时务必遵守法律法规，避免触碰法律红线。

3. 合法维权：如果借款人已经支付了超出法律保护利率上限的利息，有权要求出借人返还多余部分。在协商无果的情况下，可以向法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。

4. 重新协商或签订合法借条：对于已经存在的此类高利贷借条，建议双方重新协商利率条款，或者签订一份符合法律规定的新的借条，以确保借贷关系的合法性和有效性。

示例说明：

假设张三向李四借款1000元，并约定日利息为40元。这一约定显然违反了法律规定。如果张三已经支付了部分或全部利息，他有权要求李四返还超出法律保护利率上限的部分。如果李四拒绝返还，张三可以向法院提起诉讼，要求法院判决李四返还多余利息，并确认借条中超出部分的利息无效。

总结与建议：

在民间借贷中，双方应严格遵守法律法规，合理约定利率。对于借款人来说，要警惕高利贷陷阱，保护好自己的合法权益；对于出借人来说，也要遵守法律底线，避免因为追求高息而触犯法律。如果遇到相关法律问题或纠纷，可以直接向我咨询，我将为你提供专业的法律意见和帮助。