结论：公司本身被诈骗后，公司账户确实有可能被刑事查询，但这并非绝对，而是取决于案件的具体情况、诈骗手段、涉案金额以及司法机关的侦查需求等多种因素。
分析说明：
刑事侦查的常规手段：
- 在刑事案件中，特别是涉及金融诈骗的案件，司法机关为了查明事实、收集证据，有权对涉案的公司账户进行查询、冻结等措施。这是刑事侦查的常规手段之一，旨在防止资金被转移、隐匿或销毁，从而保障案件的顺利侦查和后续的审判工作。
诈骗手段与涉案金额的影响：
- 如果诈骗手段复杂、隐蔽，且涉案金额巨大，司法机关为了彻底查清案件事实，很可能会对公司账户进行深入查询，以追踪资金流向、查明诈骗过程。
- 相反，如果诈骗手段相对简单，涉案金额较小，且公司能够迅速提供充分证据证明自身无辜，那么司法机关对公司账户的查询可能会相对有限。
司法机关的侦查需求：
- 司法机关在侦查过程中，会根据案件进展和侦查需求来决定是否对公司账户进行查询。如果案件初期线索有限，司法机关可能会通过查询公司账户来获取更多线索；而随着案件的深入，如果已经掌握了足够的证据，那么对公司账户的查询可能会减少或停止。
公司应对措施：
- 如果公司发现自身账户被刑事查询，应积极配合司法机关的工作，提供必要的协助和证据。同时，公司也可以咨询专业律师，了解自身权利和义务，以及如何应对可能的法律后果。
法律建议：
- 保持冷静与配合：面对公司账户被刑事查询的情况，公司应保持冷静，积极配合司法机关的工作，避免因不配合而引发更严重的法律后果。
- 及时咨询律师：公司应尽快咨询专业律师，了解自身在案件中的法律地位和权利义务，以及如何应对可能的法律风险。律师可以根据案件具体情况，为公司提供专业的法律建议和辩护策略。
- 保留相关证据：公司应妥善保留与案件相关的所有证据和资料，以便在需要时提供给司法机关或律师进行审查和分析。
后续行动建议：
- 如果公司账户被刑事查询，且公司认为自身无辜或存在误解，可以及时向司法机关提出异议，并提供相关证据进行说明。
- 公司应加强内部管理，完善财务制度和风险控制机制，防止类似事件再次发生。同时，公司也可以考虑与专业的法律服务机构建立长期合作关系，以便在遇到法律问题时能够及时获得专业的法律支持和帮助。
如有任何进一步的问题或需要更详细的法律咨询，请直接向我提问。