结论：子公司被停业整顿，母公司能否参加政府采购项目，需分情况讨论，具体如下：

1. 若子公司与母公司存在独立法人资格且无直接关联影响
   根据《公司法》规定，子公司具有独立法人资格，其民事责任由自身承担。若母公司能证明其与子公司在业务、财务、人员等方面完全独立，且子公司被停业整顿的原因与母公司无关（如子公司因自身违法违规行为被处罚，但母公司未参与或不知情），则母公司通常可以正常参与政府采购项目。
   关键点：需提供证据证明独立性（如审计报告、业务合同、人员架构等），避免被认定为“关联企业串通投标”。

2. 若子公司与母公司存在关联关系且可能影响公平竞争
   若母公司与子公司存在控股、管理关系，或存在人员、业务、财务混同情形，且子公司被停业整顿的原因涉及母公司（如母公司指使子公司违法、或母公司自身存在重大违法记录），则可能被认定为“存在不良信用记录”或“影响政府采购公平性”，此时母公司可能被禁止参与投标。
   法律依据：

   • 《政府采购法》第22条：供应商需“具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度”；
     
   • 《政府采购法实施条例》第18条：单位负责人为同一人或存在直接控股、管理关系的不同供应商，不得参加同一合同项下的政府采购活动（但可分别参加不同项目）。
     

3. 特殊情形：子公司被停业整顿是否涉及母公司“重大违法记录”
   若子公司被停业整顿属于“重大违法记录”（如因串通投标、行贿等被处罚），且母公司作为控股股东或实际控制人存在过错（如未履行监管职责），则母公司可能被认定为“存在关联违法情形”，进而影响其投标资格。
   建议：母公司需自查是否因子公司行为被行政机关连带处罚（如罚款、列入失信名单等），若有则需先整改并消除影响后再投标。

实务建议：

• 母公司参与投标前，应全面梳理子公司被停业整顿的原因、处罚依据及是否涉及自身责任；
  
• 准备独立性证明材料（如子公司独立法人证书、母子公司业务分割协议等）；
  
• 若存在关联风险，可提前咨询采购人或代理机构，或通过异议/投诉程序明确资格要求。
  

如有进一步细节（如子公司被处罚的具体事由、母子公司股权结构等），可提供更多信息以便更精准分析。