有门禁系统的楼栋只允许本楼栋的人进入，这一做法在法律上是有一定依据的，但具体实施时需遵循相关法律规定，确保不侵犯他人合法权益。以下从不同角度进行分析：

1. 物业管理权限角度：

   • 物业公司作为小区的管理者，有权根据小区的管理规定和业主大会的决议，采取必要的安全防范措施，包括设置门禁系统。门禁系统的设置旨在提高小区的安全性，防止外来人员随意进入，从而保障业主的人身和财产安全。
   • 如果门禁系统的设置是经过业主大会同意，并且符合小区管理规约的规定，那么物业公司限制非本楼栋人员进入，可以视为是履行其管理职责的一种方式。

2. 业主权益角度：

   • 业主作为小区的主人，享有对小区公共区域的使用权。然而，这种使用权并非无限制的，它受到小区管理规约和法律法规的约束。
   • 如果门禁系统的设置是为了维护小区的整体安全和秩序，且没有侵犯到业主的合法权益（如合理通行权等），那么这种限制是合理的。

3. 法律法规角度：

   • 根据《物业管理条例》等相关法律法规，物业公司有权采取必要措施维护小区的安全和秩序。但同时，这些措施必须合法、合理，不得侵犯业主的合法权益。
   • 如果门禁系统的设置导致非本楼栋的业主或访客无法合理通行，或者对特定人群（如残疾人、老年人等）造成了不合理的障碍，那么这种设置可能违反了相关法律法规的规定，需要承担相应的法律责任。

4. 实际操作建议：

   • 物业公司在设置门禁系统时，应充分考虑业主的合理需求，确保门禁系统的设置不会侵犯到业主的合法权益。
   • 对于非本楼栋的业主或访客，物业公司可以采取登记、核实身份等方式进行管理，而不是简单地禁止其进入。
   • 如果业主对门禁系统的设置存在异议，可以通过业主大会或业主委员会进行协商解决，必要时可以寻求法律途径维护自己的合法权益。

总结来说，有门禁系统的楼栋只允许本楼栋的人进入，这一做法在法律上并非绝对禁止，但必须确保不侵犯他人的合法权益，并且符合小区管理规约和法律法规的规定。如果在实际操作中遇到问题，建议业主或物业公司及时咨询专业律师，以确保合法合规地处理相关事宜。