针对您提出的“代书遗嘱在法院鉴定中无效，申请人应该怎么办以及是否有诉讼时效”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

一、代书遗嘱无效的处理方式

1. 审查无效原因

   • 首先，需要明确代书遗嘱被认定无效的具体原因。这可能包括遗嘱人不具备完全民事行为能力、遗嘱内容非遗嘱人真实意思表示、形式不符合法律规定（如缺少见证人、未签名、未注明日期等）、见证人不符合法定条件，或者遗嘱内容违反法律规定或公序良俗等。

2. 存在其他有效遗嘱的处理

   • 如果被继承人除了无效的代书遗嘱外，还立有其他形式的有效遗嘱（如公证遗嘱），且该遗嘱不存在无效情形，那么应按照该有效遗嘱来分配遗产。

3. 无其他有效遗嘱的处理

   • 若不存在其他有效遗嘱，遗产将按照法定继承的规定进行分配。法定继承顺序为：第一顺序包括配偶、子女、父母；第二顺序包括兄弟姐妹、祖父母、外祖父母。继承开始后，由第一顺序继承人继承，第二顺序继承人不参与继承；没有第一顺序继承人继承的，由第二顺序继承人继承。
   • 在分配遗产时，应遵循均等分配原则，但同时要考虑对生活有特殊困难又缺乏劳动能力的继承人的照顾，以及对被继承人尽了主要扶养义务或者与被继承人共同生活的继承人的多分情况。有扶养能力和有扶养条件的继承人，不尽扶养义务的，应当不分或者少分。继承人协商同意的，也可以不均等分配。

4. 重新订立遗嘱

   • 如果遗嘱人仍有订立遗嘱的意愿和行为能力，可以依法重新选择合适的代书人及见证人，严格遵循法定程序订立新的代书遗嘱。或者，遗嘱人也可以选择公证遗嘱等其他遗嘱形式，以确保遗嘱的法律效力。

5. 协商解决或诉讼

   • 如果因遗嘱无效引发纠纷，首先应尝试通过协商解决。协商不成时，相关利害关系人可以向人民法院提起诉讼，由法院根据具体事实和法律规定对遗产的分配等问题作出公正裁决。

二、关于诉讼时效的问题

• 诉讼时效的适用：在遗嘱无效引发的遗产分配纠纷中，通常适用的是继承权纠纷的诉讼时效规定。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，继承权纠纷提起诉讼的期限为三年，自继承人知道或者应当知道其权利被侵犯之日起计算。但是，自继承开始之日起超过二十年的，不得再提起诉讼。

• 注意事项：

  • 诉讼时效的计算起点是继承人知道或者应当知道其权利被侵犯之日，而不是遗嘱被认定无效之日。因此，在发现遗嘱可能无效或权利受到侵犯时，应及时采取行动，以免错过诉讼时效。
  • 如果在诉讼时效期间内，继承人之间通过协商或其他方式解决了纠纷，那么诉讼时效将中断并重新计算。
  • 如果因不可抗力或其他正当理由导致继承人无法在诉讼时效期间内提起诉讼，可以依法申请延长诉讼时效。

三、建议

• 在处理代书遗嘱无效的问题时，建议首先咨询专业律师，以获取精准的法律建议和指导。
• 如果需要重新订立遗嘱，务必确保新遗嘱符合法律规定，并严格遵循法定程序。
• 在遗产分配过程中，应保持沟通协商，尽量通过和平方式解决纠纷，以维护家庭和谐和社会稳定。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时咨询。