针对您已还款但对方不承认的情况，您可以按照以下步骤来维护自己的合法权益：
收集并整理还款证据：
- 电子转账记录：如果您是通过银行转账、微信、支付宝等第三方支付平台进行的还款，务必保存好相关的转账记录。这些记录应清晰显示转账时间、金额、收款方信息等，是证明还款事实的直接证据。
- 书面证据：如果您在还款时取得了对方的收据，或者是在原借条上进行了备注并让对方签字确认，这些书面证据同样具有法律效力。收据应详细注明还款人、金额、时间及债务相关信息，以确保其证明力。
- 聊天记录与通话录音：如果您与对方在还款过程中有聊天记录或通话录音，且其中明确提及了还款事宜，这些也可以作为辅助证据。但请注意，录音需合法取得，不得侵犯他人隐私。
与对方进行协商：
- 在掌握充分证据的基础上，您可以尝试与对方进行协商，以平和的态度出示证据，并提醒对方回忆还款事实。协商过程中，您可以录音录像，以备不时之需。如果对方态度诚恳，愿意承认还款事实，那么问题可能就此解决。
寻求第三方调解：
- 如果协商无果，您可以寻求人民调解委员会或其他相关机构（如行业协会、商会）的调解。调解员将依据事实和法律进行公正调解，促使双方达成和解。这种方式相对灵活，且成本较低，值得一试。
提起诉讼：
- 如果调解仍然无法解决问题，您可以向有管辖权的人民法院提起诉讼。在准备起诉状时，请详细陈述您的诉讼请求、事实和理由，并附上相关证据材料。法院立案后，将安排庭审。在庭审中，您需要举证、质证、辩论，以证明自己已还款的事实。如果法院判决您胜诉，而对方不履行判决，您还可以申请强制执行，以确保自身权益得到最终实现。
特别提示：
- 在整个过程中，保持冷静和理性至关重要。避免采取过激行为或言语攻击，以免激化矛盾。
- 证据的收集和保存是解决问题的关键。请务必确保证据的真实性、合法性和关联性。如果证据不足或存在瑕疵，可能会影响您的诉讼结果。
- 如果您在收集证据或处理纠纷过程中遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询。作为专业律师，我将根据您的具体情况提供针对性的法律建议和指导。
法律背景：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人对自己提出的主张有责任提供证据。因此，在还款纠纷中，您需要承担举证责任，证明自己已经履行了还款义务。
- 如果对方否认还款事实，但无法提供相反证据或反驳您的证据，法院可能会根据您提供的证据认定还款事实成立。
可能后果：
- 如果您能够提供充分且有效的证据证明还款事实，那么您有望通过协商、调解或诉讼等方式解决纠纷，维护自己的合法权益。
- 如果您无法提供足够证据或证据存在瑕疵，可能会导致您的诉讼请求被驳回或无法得到全额支持。因此，在处理此类纠纷时，务必重视证据的收集和保存工作。