结论：在您已交违纪款和悔过书两个月后还未收到通知的情况下，案件可能处于多个不同的程序阶段，具体取决于案件的性质、复杂程度以及当地交通管理部门的处理流程。以下是一些可能的情况及解释：
案件仍在审核阶段：
- 交通管理部门在收到您的违纪款和悔过书后，可能需要对案件进行进一步的审核和调查。这包括核实您的违章事实、审查相关证据、确认罚款金额等。如果案件较为复杂或涉及多个违章行为，审核过程可能会相对较长。
通知尚未发出：
- 即使案件已经审核完毕，交通管理部门也可能因为各种原因（如内部流程、系统故障、人员疏忽等）尚未向您发出处理通知。这种情况下，您可以主动联系交通管理部门，询问案件的处理进度和结果。
案件已处理完毕但未通知到您：
- 在某些情况下，交通管理部门可能已经完成了对案件的处理，但由于通知方式不当或您联系方式变更等原因，导致您未能及时收到通知。您可以检查自己的联系方式是否准确无误，并主动联系交通管理部门确认。
案件进入其他程序：
- 如果您的违章行为涉及较为严重的后果（如造成交通事故、逃逸等），案件可能不仅仅停留在罚款和悔过的层面，而是可能进入更复杂的法律程序，如行政复议、行政诉讼等。这种情况下，处理时间可能会更长，且需要您配合更多的法律程序。
建议：
- 主动联系交通管理部门：由于您已经等待了两个月，建议您主动联系当地的交通管理部门，询问案件的处理进度和结果。这可以帮助您及时了解案件状态，避免因为信息不畅而产生的焦虑和误解。
- 保留相关证据：在联系交通管理部门时，建议您准备好相关的违章证据（如违章照片、罚款单等）以及您的悔过书和缴费凭证。这些证据可以帮助您更清晰地阐述自己的情况，并加快案件的处理速度。
- 关注后续通知：无论案件处于哪个阶段，您都应该保持联系方式的畅通，并密切关注交通管理部门发出的任何通知。如果收到通知，请按照通知要求及时配合处理。
法律背景：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，交通管理部门对违章行为有权进行处罚，并有权要求违章者缴纳罚款、提交悔过书等。同时，交通管理部门也有义务在合理时间内向违章者发出处理通知，并告知其权利义务。
如果您在联系交通管理部门或处理案件过程中遇到任何问题，或者对案件的处理结果有异议，都可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。