在离婚协议中就双方共同经营的店铺进行约定时，需综合考虑店铺的产权归属、经营权分配、债务承担及未来收益分配等多个方面。以下是一些核心要点及具体约定方式：

1. 产权归属明确：

   • 若店铺为夫妻共同财产购买或租赁，应明确离婚后店铺的产权归属。可以选择由一方继续经营并承担相应产权费用，或出售店铺后分割所得款项。
   • 若店铺涉及第三方产权（如租赁店铺），需明确租赁合同的变更或解除事宜，以及由此产生的费用承担。

2. 经营权分配：

   • 确定离婚后店铺由哪一方继续经营，或双方共同经营但明确各自职责。
   • 若由一方继续经营，应约定另一方不得干涉经营事务，并放弃对店铺的日常管理权。
   • 若双方共同经营，需详细约定利润分配、亏损承担及决策机制等。

3. 债务承担：

   • 明确店铺在婚姻关系存续期间产生的债务由哪一方承担，或双方按比例分担。
   • 约定离婚后新产生的债务与另一方无关，除非得到另一方的书面同意。

4. 未来收益分配：

   • 若店铺在离婚后继续产生收益，应约定收益的分配方式，如按比例分配、固定金额分配或一方放弃收益等。
   • 考虑店铺的增值部分如何分配，特别是当店铺价值因市场变化而显著增长时。

5. 过渡期安排：

   • 设定一个合理的过渡期，以便双方有时间处理店铺的交接事宜，如客户通知、供应商沟通、员工安置等。
   • 约定过渡期内店铺的经营方式、收益分配及费用承担等。

6. 违约责任：

   • 明确双方违反离婚协议中关于店铺约定的法律责任，包括赔偿损失、支付违约金等。
   • 约定争议解决方式，如协商、调解或诉讼等。

示例条款： “双方同意，位于[店铺地址]的店铺归[甲方/乙方]所有，该方应继续履行与房东签订的租赁合同，并承担后续租金及其他相关费用。离婚后，店铺的经营权归[甲方/乙方]所有，[另一方]不得干涉。店铺在婚姻关系存续期间产生的债务由[甲方/乙方]承担，离婚后新产生的债务与[另一方]无关。店铺的未来收益按[比例/固定金额]分配给双方。若任何一方违反本协议约定，应向另一方支付违约金[金额]，并赔偿因此造成的损失。”

在制定离婚协议时，建议双方充分沟通、协商，并寻求专业法律人士的帮助，以确保协议的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。