在三方协议中，四份协议的分配通常遵循以下原则，以确保各方的权益得到保障并便于协议的执行与管理：
各方各执一份：
- 这是最常见且合理的分配方式。在三方协议中，通常会有三个签约方，即甲方、乙方和丙方。为了确保每个签约方都能持有并了解协议的全部内容，以及在需要时能够出示协议作为证据，每个签约方通常会各持有一份协议原件。这样，各方在履行协议过程中，都能依据自己持有的协议来主张权利或履行义务。
额外一份用于备案或存档：
- 除了各方各执一份外，有时还会额外准备一份协议用于备案或存档。这份协议可能由某一特定方（如甲方或协议起草方）保管，或者根据协议的具体要求或相关法律法规的规定，提交给某个机构（如工商部门、行业协会等）进行备案。备案或存档的目的是为了在需要时能够提供协议的官方副本，以证明协议的存在及其内容。
在实际操作中，协议的分配方式可能会因具体情况而有所不同。例如，如果三方协议中涉及到的某一方是政府部门或具有特殊地位的机构，那么该机构可能会要求持有两份协议原件，或者协议的其他分配方式可能需要根据该机构的特定要求来确定。此外，如果协议中明确规定了协议的分配方式，那么各方应严格按照协议中的规定来执行。
建议：
- 在签订三方协议前，各方应明确协议的分配方式，并在协议中予以明确约定。这样可以避免在协议签订后因协议分配问题而产生纠纷。
- 如果对协议的分配方式有疑问或不确定，建议咨询专业律师或法律顾问的意见，以确保协议的分配方式合法、合理且符合各方的利益。
如有任何关于三方协议或其他合同纠纷的法律问题，欢迎直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律建议。