已归档的案件被执行人还款，通常需通过法院指定的账户或直接联系执行法官进行还款操作。具体来说，已归档的案件若仍处于执行阶段，被执行人应按照以下步骤进行还款：
确认还款方式：
- 被执行人应首先联系执行法院或执行法官，确认还款的具体方式。法院通常会指定一个专门的账户用于接收还款，或者要求被执行人直接到法院财务部门进行还款。
- 在某些情况下，法院也可能允许被执行人通过电子支付方式（如银行转账、支付宝、微信支付等）进行还款，但需确保支付账户与法院指定的账户一致，并保留好支付凭证。
履行还款义务：
- 被执行人应按照生效法律文书确定的金额和期限，及时足额地履行还款义务。
- 如果被执行人无法一次性还清全部款项，可以与申请执行人协商分期还款，并征得法院的同意。分期还款计划应明确还款金额、期限和方式等关键条款。
保留还款证据：
- 被执行人在还款过程中应保留好所有相关的还款证据，如银行转账记录、收据、法院出具的收款证明等。
- 这些证据在后续可能出现的争议中具有重要的证明作用，可以确保被执行人的还款行为得到认可。
关注案件进展：
- 被执行人在还款后应关注案件的进展情况，确保法院及时更新案件状态并解除相应的执行措施。
- 如果被执行人发现法院未及时更新案件状态或存在其他问题，可以及时向法院提出异议或申请复议。
特殊情况说明：
- 如果案件已经执行完毕并归档，但被执行人发现仍有未履行的义务或法院存在错误执行的情况，被执行人应及时向法院提出书面异议，并提供相关证据支持自己的主张。
- 在某些情况下，被执行人可能因特殊原因（如经济困难、疾病等）无法按时履行还款义务。此时，被执行人可以向法院申请暂缓执行或分期执行，并提供相应的证明材料。法院会根据实际情况进行审查并作出决定。
建议：
- 被执行人在还款过程中应积极配合法院的工作，遵守法律法规和执行程序的要求。
- 如果被执行人对还款方式、金额或期限等存在疑问或争议，可以及时向法院咨询或寻求法律帮助。