结论：查明的案件事实变更后，一般不可以以同一企业重复申请工伤认定，但在特定情形下可重新申请或通过其他途径救济。

1. 一般情形下不可重复申请工伤认定

根据《工伤保险条例》第十七条，职工发生事故伤害或被诊断为职业病后，用人单位应在30日内、职工或其近亲属可在1年内向社保部门提出工伤认定申请。若社保部门已作出认定结论（如认定为工伤或非工伤），且该结论已生效（未被行政复议或行政诉讼撤销），则同一事实下不得重复申请。
法律依据：

• 《工伤保险条例》第五十五条明确，申请工伤认定的职工或其近亲属、该职工所在单位对工伤认定结论不服的，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，但未规定可重复申请认定。
  
• 行政行为的公定力原则要求，已生效的工伤认定结论具有法律效力，非经法定程序不得随意变更或撤销。

2. 特定情形下可重新申请或救济

若案件事实发生实质性变更（如新证据证明原认定事实错误、原伤害与后续病情存在因果关系等），可通过以下途径处理：

（1）申请行政复议或行政诉讼

若原工伤认定结论存在程序违法（如未调查取证、超越职权）或实体错误（如事实认定不清、法律适用错误），可在知道该行政行为之日起60日内申请行政复议，或在6个月内直接提起行政诉讼，要求撤销原结论并重新认定。
示例：原认定未考虑职工后续因工伤导致的并发症，新证据证明并发症与工伤直接相关，可通过诉讼要求重新认定。

（2）申请劳动能力复查鉴定

若工伤职工的伤残等级发生变化（如病情恶化），可在原劳动能力鉴定结论作出之日起1年后，向设区的市级劳动能力鉴定委员会申请复查鉴定，并根据新结果调整工伤保险待遇。
法律依据：

• 《工伤保险条例》第二十八条：“自劳动能力鉴定结论作出之日起1年后，工伤职工或者其近亲属、所在单位或者经办机构认为伤残情况发生变化的，可以申请劳动能力复查鉴定。”
  

（3）补充申报新发生的工伤事实

若原工伤认定后，职工又因同一工作原因发生新的伤害事实（如原工伤未完全治愈导致二次受伤），可就新事实单独申请工伤认定，但需证明新伤害与工作存在直接因果关系。
注意：此情形不属于“重复申请”，而是针对新事实的独立认定。

3. 实务建议

• 及时固定证据：若发现原认定事实有误，应尽快收集医疗记录、证人证言等新证据，避免证据灭失。
  
• 区分救济途径：对认定结论不服的，优先选择行政复议或诉讼；对伤残等级有异议的，申请复查鉴定；对新伤害事实的，单独申请认定。
  
• 咨询专业律师：工伤认定程序涉及行政法、劳动法等多领域交叉问题，建议根据具体案情制定策略。
  

如有进一步疑问或需分析具体案情，可直接向我咨询。