立案后发现是误会，是否可以撤案，需根据案件性质及所处诉讼阶段来具体分析。以下从不同角度为你详细阐述：
一、刑事案件
立案侦查阶段：
- 在刑事案件立案后，如果公安机关发现案件是误会，即不存在犯罪事实或者犯罪事实显著轻微，不需要追究刑事责任，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，公安机关应当撤销案件。
- 法律依据：《刑事诉讼法》第一百六十三条，在侦查过程中，发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的，应当撤销案件；犯罪嫌疑人已被逮捕的，应当立即释放，发给释放证明，并且通知原批准逮捕的人民检察院。
审查起诉阶段：
- 如果案件已经移送至检察院审查起诉，检察院经审查认为案件是误会，即犯罪事实不清、证据不足或者不存在犯罪事实，检察院可以作出不起诉决定。
- 法律依据：《刑事诉讼法》第一百七十七条，犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有本法第十六条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。
审判阶段：
- 如果案件已经进入审判阶段，法院在审理过程中发现案件是误会，即证据不足，不能认定被告人有罪的，法院应当作出无罪判决。
- 法律依据：《刑事诉讼法》第二百条，证据不足，不能认定被告人有罪的，应当作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。
二、民事案件
立案后、开庭前：
- 在民事案件立案后，开庭前，如果原告发现案件是误会，即起诉的事实和理由不成立，原告可以向法院申请撤诉。法院经审查，认为撤诉申请符合法律规定的，会裁定准许撤诉。
- 法律依据：《民事诉讼法》第一百四十八条，宣判前，原告申请撤诉的，是否准许，由人民法院裁定。
开庭后、判决前：
- 如果案件已经开庭审理，原告在审理过程中发现案件是误会，仍然可以向法院申请撤诉。但此时撤诉需要法院根据案件具体情况进行审查，如果撤诉可能损害国家利益、社会公共利益或者他人合法权益的，法院可能不予准许。
- 法律依据：同样依据《民事诉讼法》第一百四十八条，但此时法院的审查更为严格。
判决后：
- 如果案件已经作出判决，原告发现案件是误会，此时不能直接撤诉，但可以通过上诉或者申请再审等法律程序来寻求救济。
三、行政案件
行政案件的撤诉规定与民事案件类似。在立案后、开庭前，原告可以向法院申请撤诉；开庭后、判决前，原告也可以申请撤诉，但需经法院审查。如果案件已经作出判决，原告发现案件是误会，同样需要通过上诉或者申请再审等法律程序来寻求救济。
总结与建议：
- 如果你涉及的案件是刑事案件，且处于立案侦查阶段，发现是误会后，应尽快向公安机关说明情况，申请撤销案件。
- 如果案件已经进入审查起诉或审判阶段，应积极配合检察院或法院的工作，提供相关证据和材料，以证明案件是误会。
- 如果你涉及的案件是民事或行政案件，且处于立案后、开庭前阶段，发现是误会后，可以向法院申请撤诉。如果案件已经开庭审理或作出判决，应考虑通过上诉或申请再审等法律程序来寻求救济。
在处理此类问题时，建议你及时咨询专业律师，以便更准确地了解案件情况和法律程序，更好地维护自己的合法权益。如果你有任何法律问题，都可以直接向我咨询。