在组织卖淫罪案件中，若证据不足，法院通常会依法作出无罪判决或证据不足不起诉决定，但具体处理方式需结合案件阶段和证据情况综合判断。以下是详细分析：

1. 侦查阶段：证据不足时的处理
   根据《刑事诉讼法》第175条，若公安机关认为证据不足，可补充侦查（最多2次，每次1个月）。若补充侦查后仍证据不足，检察院应作出不起诉决定（存疑不起诉）。此时，犯罪嫌疑人不会被移送法院审判，案件终结。

2. 审查起诉阶段：证据不足的后果
   检察院审查案件时，若认为证据不足、不符合起诉条件，可依据《刑事诉讼法》第177条直接作出不起诉决定。若检察院决定起诉，但法院审理中发现证据不足，则可能判决无罪。

3. 审判阶段：证据不足的判决结果
   根据《刑事诉讼法》第200条，法院审理后认为证据不足、不能认定被告人有罪的，应作出无罪判决。这是“疑罪从无”原则的直接体现，即“事实不清、证据不足”时，法院不得推定有罪。

4. 证据不足的具体表现

   • 缺乏直接证据（如组织者与卖淫者的书面协议、转账记录等）；
     
   • 间接证据无法形成完整链条（如仅有证人证言，但无其他物证、书证佐证）；
     
   • 关键证据存在瑕疵（如非法取证、证据来源不明等）。

5. 实务中的注意事项

   • 若案件被退回补充侦查，嫌疑人仍可能被继续羁押，需及时申请取保候审；
     
   • 即使证据不足，若嫌疑人被批捕，仍可能面临较长时间的羁押，需通过法律程序争取释放；
     
   • 证据不足的案件中，嫌疑人及家属应积极配合律师，通过申请非法证据排除、调取新证据等方式推动案件终结。

总结：组织卖淫罪案件中，证据不足的直接后果是检察院不起诉或法院判决无罪。但具体处理需结合案件阶段（侦查、审查起诉、审判）和证据瑕疵程度综合判断。若您或家人涉及此类案件，建议尽快委托律师介入，通过专业分析证据链、申请取保候审等方式维护合法权益。