结论：有限公司注销时股东不配合签名，公司可以通过依法定程序召开股东会形成有效决议、利用法院裁判文书替代股东签名或通过协商、调解等方式解决。

详细分析：

1. 依法定程序召开股东会并形成有效决议：

   • 法律依据：根据《公司法》及相关规定，公司注销需经过股东会决议，且该决议需代表一定比例表决权的股东通过（通常为三分之二以上）。若股东不配合签名，但公司能够依法定程序召开股东会，并确保出席会议的股东所持表决权达到法定比例，那么形成的决议仍具有法律效力。
   • 操作建议：公司应提前通知所有股东参加股东会，并明确会议议题为讨论公司注销事宜。在会议上，应详细记录会议过程、股东发言及表决情况，确保决议的形成符合法定程序。若部分股东未出席或反对，但出席会议的股东所持表决权达到法定比例，则决议有效。

2. 利用法院裁判文书替代股东签名：

   • 适用情形：若股东会无法形成有效决议，或部分股东拒绝在注销文件上签名，且该股东的行为严重阻碍了公司注销进程，公司可以考虑通过法律途径解决。
   • 操作建议：公司可以向法院提起诉讼，请求法院确认公司注销的合法性，并判决相关股东履行配合义务。在获得法院生效裁判文书后，公司可以凭该文书办理注销手续，无需再依赖股东签名。

3. 协商与调解：

   • 法律依据：虽然法律未明确规定股东必须配合公司注销，但股东之间应本着诚信、合作的原则处理公司事务。若股东不配合签名，可能构成对公司及其他股东权益的侵害。
   • 操作建议：公司可以尝试与不配合的股东进行协商，了解其不配合的原因，并寻求解决方案。若协商无果，可以考虑邀请第三方（如行业协会、调解机构等）进行调解，以达成双方都能接受的解决方案。

后续行动建议：

• 在处理股东不配合签名的问题时，公司应确保所有操作均符合法律法规的规定，避免因程序瑕疵而导致注销无效或引发其他法律纠纷。
• 若公司决定通过法律途径解决，应及时咨询专业律师，了解诉讼风险及可能的结果，并制定合理的诉讼策略。
• 在整个注销过程中，公司应保持与股东的沟通，尽量通过协商、调解等方式解决问题，以维护公司及股东之间的良好关系。

法律后果提示：

• 若公司未经法定程序注销，或注销过程中存在违法行为，可能面临行政处罚、民事赔偿等法律责任。
• 股东若拒绝配合公司注销，且其行为构成对公司及其他股东权益的侵害，可能需承担相应的法律责任。

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