面对克扣员工工资的上司，员工可以采取以下措施维护自身权益：

1. 明确克扣工资的性质与证据收集
   首先需确认“克扣工资”的具体情形，例如是否为未足额支付劳动报酬、无故拖欠工资，或以罚款、扣款等名义减少工资。根据《劳动法》第五十条及《劳动合同法》第三十条，用人单位必须足额、及时支付劳动报酬，克扣行为已涉嫌违法。
   行动建议：

   • 保存工资条、银行流水、劳动合同等证明劳动关系及工资标准的材料；
     
   • 记录上司克扣工资的口头或书面理由（如聊天记录、邮件、录音等）；
     
   • 若公司有规章制度涉及扣款，需核实该制度是否经民主程序制定、是否公示或告知员工（未满足则无效）。

2. 与公司协商或通过内部渠道解决
   若克扣金额较小或因误解产生，可优先尝试与上司或HR沟通，要求书面说明扣款原因并补发工资。若公司拒绝，可向工会或职工代表大会反映情况（如有）。
   注意：协商时需保持冷静，避免情绪化冲突，同时明确告知对方克扣工资的违法性及自身维权意愿。

3. 向劳动监察部门投诉
   若协商无果，可向当地劳动保障监察大队投诉（可通过12333热线或官网查询地址）。监察部门有权责令公司限期支付工资，逾期不付可加付赔偿金（《劳动合同法》第八十五条）。
   优势：处理周期短（通常60日内结案），无需支付费用，适合快速解决纠纷。

4. 申请劳动仲裁
   若克扣金额较大或涉及复杂争议（如公司主张扣款合法但无证据），可直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求：

   • 支付被克扣的工资及25%经济补偿金（《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》第三条，部分地区适用）；
     
   • 若因克扣工资被迫离职，可主张经济补偿金（按工作年限，每满一年支付一个月工资）。
     流程：提交仲裁申请书、证据材料（一式两份），仲裁委受理后45日内裁决（复杂案件可延长15日）。

5. 提起诉讼（仲裁后）
   若对仲裁结果不服，可在收到裁决书15日内向法院起诉。诉讼阶段可进一步主张加班费、未签合同双倍工资等关联权益（如有）。

风险提示：

• 维权过程中需避免采取过激行为（如罢工、破坏公司财物），否则可能承担法律责任；
  
• 若公司以“严重违纪”等理由合法解雇，需核实其依据是否充分（如规章制度是否合法、证据是否确凿），否则可能构成违法解除，需支付赔偿金。

总结：克扣工资是明确的违法行为，员工应优先通过协商、投诉或仲裁解决，必要时委托律师介入以提高效率。若需进一步分析具体情形或协助准备材料，可直接向我咨询。