在建设工程合同纠纷中，内部承包协议的质证要点主要包括以下几个方面：

1. 协议的真实性与合法性：

   • 真实性：首先需确认内部承包协议是否真实存在，是否为双方真实意思表示，有无伪造、篡改等情形。这通常通过核对协议原件、双方签字或盖章的真实性、以及是否有其他辅助证据（如邮件、短信确认等）来证明。
   • 合法性：审查协议内容是否违反法律法规的强制性规定，如是否涉及非法转包、违法分包等违法行为。若协议内容违法，则可能被认定为无效，从而影响后续的权利义务分配。

2. 协议条款的明确性与完整性：

   • 明确性：协议中的各项条款应表述清晰，无歧义，特别是关于工程范围、工期、质量标准、价款及支付方式、违约责任等关键条款，必须明确具体，以便在纠纷发生时能够准确界定双方的权利义务。
   • 完整性：协议应涵盖双方约定的所有事项，避免遗漏重要条款。若协议存在重大遗漏，可能导致双方对某些事项的理解不一致，进而引发纠纷。

3. 双方权利义务的合理性：

   • 权利义务对等：审查协议中双方的权利义务是否对等，是否存在一方利用优势地位强迫另一方接受不公平条款的情况。若权利义务明显失衡，可能影响协议的公平性和有效性。
   • 实际履行情况：结合协议的实际履行情况，分析双方是否按照协议约定履行了各自的义务。若一方未履行或未完全履行协议义务，则可能构成违约，需承担相应的法律责任。

4. 变更与解除的合法性：

   • 变更程序：若协议在履行过程中发生变更，需审查变更程序是否合法，是否经过双方协商一致并签订书面变更协议。未经协商一致的变更可能无效。
   • 解除条件：审查协议中约定的解除条件是否成就，以及解除程序是否合法。若一方擅自解除协议或解除程序不合法，可能构成违约或侵权，需承担相应的法律责任。

5. 证据的充分性与关联性：

   • 证据充分性：在质证过程中，需确保所提供的证据能够充分证明自己的主张或反驳对方的主张。证据应具有客观性、关联性和合法性，能够形成完整的证据链。
   • 证据关联性：证据应与案件事实具有直接关联，能够证明或反驳协议中的某项条款或双方的权利义务关系。无关证据应予以排除，以免影响案件的审理效率。

在质证过程中，还需注意以下几点：

• 仔细审查对方提供的证据：对对方提供的证据进行仔细审查，分析其真实性、合法性和关联性，找出其中的漏洞或矛盾点，以便在质证时进行有力反驳。
• 积极举证支持自己的主张：根据案件事实和法律规定，积极举证支持自己的主张或反驳对方的主张。举证时应注重证据的充分性和关联性，确保能够形成完整的证据链。
• 注意质证技巧：在质证过程中，应注意质证技巧的运用，如针对对方证据的弱点进行有力反驳、利用对方证据中的矛盾点进行质疑等。同时，要保持冷静和理性，避免情绪化表达或攻击对方。

若您在内部承包协议质证过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和解决方案。