结论：实控人资金占用时，财务总监是否有责任需视具体情况而定，可能涉及民事责任、行政责任甚至刑事责任。以下从不同角度进行详细分析：
一、民事责任角度
若财务总监未尽到忠实和勤勉义务：
- 根据《公司法》及相关司法解释，公司董事、监事、高级管理人员（包括财务总监）对公司负有忠实和勤勉义务。若财务总监在实控人资金占用过程中，未尽到应有的注意义务，未及时发现或阻止该行为，可能被视为违反了忠实和勤勉义务。
- 在此情况下，公司或其他股东有权要求财务总监承担赔偿责任，赔偿因资金占用给公司造成的损失。
若财务总监参与或协助实控人资金占用：
- 若财务总监直接参与或协助实控人进行资金占用，如提供虚假财务报告、隐瞒资金流向等，则财务总监与实控人构成共同侵权，需承担连带赔偿责任。
二、行政责任角度
若财务总监违反财务监管规定：
- 根据《会计法》、《企业会计准则》等相关规定，财务总监作为公司财务管理的负责人，需确保公司财务活动的合法性和合规性。若财务总监在实控人资金占用过程中，违反相关财务监管规定，如未按规定进行财务核算、未及时报告资金异常等，可能面临行政处罚，如罚款、警告等。
若财务总监未履行信息披露义务：
- 在上市公司中，若实控人资金占用行为达到信息披露标准，而财务总监作为信息披露义务人之一，未及时、准确、完整地披露相关信息，可能面临证券监管机构的行政处罚，如罚款、市场禁入等。
三、刑事责任角度
若财务总监构成职务侵占罪或挪用资金罪的共犯：
- 若实控人资金占用行为构成职务侵占罪或挪用资金罪，而财务总监作为共犯参与其中，如提供资金转移渠道、协助伪造财务凭证等，则财务总监可能面临刑事追究，承担相应的刑事责任。
若财务总监构成背信损害上市公司利益罪：
- 在上市公司中，若实控人资金占用行为严重损害上市公司利益，而财务总监作为上市公司的高级管理人员，未履行忠实和勤勉义务，可能构成背信损害上市公司利益罪，面临刑事追究。
四、建议与风险提示
加强内部监控与审计：
- 公司应建立健全内部监控和审计机制，确保财务活动的透明度和合规性。财务总监应积极参与并推动相关机制的建立和完善，以降低资金占用等违规行为的风险。
及时报告与披露：
- 若发现实控人存在资金占用行为，财务总监应及时向公司董事会、监事会报告，并按照相关规定进行信息披露，以避免因未及时报告或披露而承担法律责任。
寻求专业法律支持：
- 面对复杂的法律问题，财务总监应积极寻求专业法律支持，如咨询律师或法律顾问，以确保自身行为的合法性和合规性。
如有具体法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供更为详细和专业的法律解答。