店铺存在经济纠纷时，原则上是可以转让的，但转让行为可能受到一定限制，且转让后纠纷的处理方式会因具体情况而有所不同。以下从多个角度为你详细分析：

一、转让的合法性

1. 法律未禁止：从法律层面来看，并没有明确规定存在经济纠纷的店铺不能转让。只要店铺的产权或经营权清晰，且转让行为不违反法律法规的强制性规定（如未涉及非法经营、未损害国家、集体或第三人利益等），转让行为就是合法的。

2. 合同约定：如果店铺是租赁的，那么转让行为还需受到租赁合同的约束。如果租赁合同中明确规定了禁止转让或转让需经出租人同意等条款，那么转让行为就必须遵守这些约定，否则可能构成违约。

二、转让后的纠纷处理

1. 转让前纠纷：如果店铺在转让前已经存在经济纠纷，那么这些纠纷并不会因为店铺的转让而自动消失。原店铺经营者（转让方）仍然需要承担相应的法律责任。新店铺经营者（受让方）在接手店铺后，如果因原纠纷受到牵连，可以根据转让协议中的相关条款向转让方追偿。

2. 转让后纠纷：如果店铺在转让后发生经济纠纷，那么纠纷的处理将取决于纠纷的性质和原因。如果纠纷是由于新店铺经营者的经营行为引起的，那么新店铺经营者需要自行承担法律责任。如果纠纷与转让前的经营行为有关，但新店铺经营者对此并不知情且无过错，那么新店铺经营者可能不需要承担法律责任，但具体还需根据案件情况来判断。

三、转让时的注意事项

1. 尽职调查：在接手存在经济纠纷的店铺前，新店铺经营者应该进行充分的尽职调查，了解店铺的财务状况、法律纠纷情况、合同履行情况等，以评估转让的风险和可行性。

2. 明确责任：在转让协议中，应该明确约定转让前后的责任划分。例如，可以约定转让方负责处理转让前的所有经济纠纷，受让方负责处理转让后的经营行为引起的纠纷等。

3. 合法转让：确保转让行为符合法律法规的规定，避免因转让行为本身违法而引发新的法律纠纷。

四、可能面临的法律后果

1. 如果转让行为违法：如未经出租人同意擅自转让租赁店铺、转让非法经营的店铺等，转让方和受让方都可能面临行政处罚或刑事责任。

2. 如果转让后纠纷处理不当：如新店铺经营者未能妥善处理转让前的经济纠纷，导致原债权人向新店铺经营者追偿的，新店铺经营者可能需要承担相应的法律责任。

建议：在接手存在经济纠纷的店铺前，务必咨询专业律师（即我，何青松律师，专注于经济纠纷等领域），进行充分的尽职调查和风险评估。如果店铺确实存在较大的经济纠纷风险，建议谨慎考虑是否接手。如果已经接手，且面临经济纠纷，也应及时向我咨询，以便采取合适的法律措施维护自身权益。