企业高层因欠农民工工资被传唤，并不一定会被扣押。这一结论主要基于以下几点法律分析和实际情况考量：

1. 传唤与扣押的法律区别：

   • 传唤是司法机关通知犯罪嫌疑人或涉案人员到指定地点接受询问的一种措施，它本身并不涉及对人身自由的限制。
   • 扣押，通常指的是对犯罪嫌疑人或涉案人员的身体进行强制限制，如拘留或逮捕，这需要严格的法律程序和证据支持。

2. 欠薪行为的法律性质：

   • 欠薪行为主要违反的是劳动法律法规，属于民事纠纷范畴，但在某些情况下，如恶意欠薪且数额较大，可能构成拒不支付劳动报酬罪，此时就涉及刑事责任。
   • 即使构成刑事犯罪，也需要经过公安机关的立案侦查、检察机关的审查起诉以及法院的审判等程序，才能决定是否对犯罪嫌疑人采取扣押等强制措施。

3. 传唤后的处理情况：

   • 如果企业高层被传唤后，能够积极配合调查，如实陈述事实，并主动解决欠薪问题，那么通常不会被扣押。
   • 如果企业高层在传唤后拒不配合，或者存在逃避、抗拒调查的行为，且欠薪行为构成犯罪，那么司法机关可能会根据具体情况决定是否对其采取扣押等强制措施。

4. 实际案例与法律实践：

   • 在实际法律实践中，对于欠薪行为，司法机关通常会优先通过调解、协商等方式解决，以维护劳动者的合法权益和社会的和谐稳定。
   • 只有在欠薪行为构成犯罪，且犯罪嫌疑人存在逃避、抗拒调查等行为时，司法机关才会考虑采取扣押等强制措施。

建议：

• 对于企业高层而言，如果因欠薪问题被传唤，应积极配合调查，如实陈述事实，并尽快解决欠薪问题，以避免不必要的法律纠纷和后果。
• 如果欠薪问题确实存在且难以解决，建议寻求专业法律帮助，通过合法途径维护自身权益，同时避免触犯法律红线。

如有任何进一步疑问或需要具体的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。