工程施工总承包单位在符合资质条件且合同约定的情况下，可以施工桩基工程。具体分析如下：
资质条件角度
根据《建筑业企业资质标准》，桩基工程属于地基与基础工程专业承包范围。若总承包单位同时持有地基与基础工程专业承包资质，或其总承包资质等级包含桩基施工能力（如建筑工程施工总承包一级资质通常涵盖桩基工程），则可直接施工桩基。若总承包单位无专项资质，需将桩基工程分包给具备相应资质的专业承包单位。
合同约定角度
即使总承包单位具备资质，仍需以施工合同约定为准。若合同明确约定桩基工程由总承包单位实施，则其可依法施工；若合同未约定或约定由分包单位实施，则需通过合法分包程序完成，总承包单位不得擅自施工。
法律风险角度
若总承包单位无资质或超越资质施工桩基，可能面临《建筑法》第六十五条规定的行政处罚（责令改正、罚款、停业整顿等），且工程质量问题需承担连带赔偿责任。若通过违法分包实施，还可能因违反《招标投标法》第四十八条被追究法律责任。
建议：施工前核查企业资质证书范围，确认合同条款是否允许自行施工桩基，必要时通过补充协议明确权利义务。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。