关于仲裁确认劳动关系申请补交社保的时效问题，结论如下：

1. 确认劳动关系的仲裁时效
   根据《劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或应当知道权利被侵害之日起计算。但劳动关系确认属于形成权，不适用时效限制（参考《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律问题的解释（一）》第一条）。因此，申请仲裁确认劳动关系本身不受一年时效限制，即使劳动关系终止后也可主张。

2. 补缴社保的时效限制
   社保补缴属于行政征收范畴，时效规则与劳动仲裁不同：

   • 行政处理时效：根据《社会保险法》第六十三条，社保征收机构对用人单位未缴、少缴社保的，责令补缴不受两年时效限制（即无论欠缴多久，均可要求补缴）。
     
   • 实践中的窗口期：部分地区社保部门可能因系统或政策原因，对补缴期限设置内部限制（如仅允许补缴最近2-3年），但此限制缺乏法律依据，劳动者可通过行政复议或诉讼主张权利。

3. 操作建议

   • 优先确认劳动关系：若劳动关系存疑（如未签合同、工资发放主体不一致），需先通过仲裁确认劳动关系，再凭裁决书要求社保补缴。
     
   • 同步主张权利：在仲裁确认劳动关系时，可一并要求用人单位配合补缴社保，避免程序拖延。
     
   • 留存证据：保存工资条、考勤记录、工作证等证明劳动关系的材料，以及社保缴费记录（证明欠缴事实）。

总结：确认劳动关系无时效限制，但补缴社保需以劳动关系确认为前提。社保补缴理论上不受时效限制，但实践中可能面临地方政策障碍，建议尽早主张权利。如有具体案件细节，可进一步向我咨询。