挂牌督办违法占地案件的依据主要来源于各级自然资源管理部门制定的相关规章制度，这些规章制度旨在严厉打击自然资源违法违规行为，维护自然资源管理秩序。以下是对挂牌督办违法占地案件依据的详细解释：

一、法律法规基础

虽然直接的法律法规可能并未明确提及“挂牌督办”这一具体措施，但《土地管理法》、《矿产资源法》等相关法律法规为自然资源管理部门打击违法占地、违法采矿等行为提供了法律基础。这些法律法规明确了违法行为的定义、处罚措施以及自然资源管理部门的职责和权力。

二、部门规章与规范性文件

1. 《自然资源部挂牌督办和公开通报违法违规案件办法》：

   • 这是自然资源部制定的一项重要规章，为挂牌督办和公开通报违法违规案件提供了明确的操作指南。
   • 该办法规定了挂牌督办的适用范围、程序、要求以及公开通报的方式和内容等，确保了挂牌督办工作的规范性和有效性。

2. 地方自然资源管理部门制定的类似办法：

   • 除了自然资源部制定的办法外，各地自然资源管理部门也根据本地实际情况制定了类似的挂牌督办和公开通报违法违规案件办法。
   • 这些地方性规章或规范性文件进一步细化了挂牌督办的程序和要求，使其更加符合本地实际，增强了可操作性。

三、挂牌督办的具体依据

在挂牌督办违法占地案件时，自然资源管理部门通常会依据以下方面：

1. 违法行为的严重性：

   • 对于严重违反土地管理法律法规、占用大量耕地或基本农田、造成恶劣社会影响的违法占地案件，自然资源管理部门会考虑将其列为挂牌督办案件。

2. 社会关注度：

   • 对于社会关注度高、群众反映强烈的违法占地案件，自然资源管理部门也会将其列为挂牌督办案件，以回应社会关切，维护社会稳定。

3. 典型性和警示作用：

   • 挂牌督办案件通常具有典型性和警示作用，通过公开通报和处理这些案件，可以警示其他单位和个人遵守土地管理法律法规，防止类似违法行为的发生。

四、实际操作中的案例

以您提供的案例为例，河南省自然资源厅和天水市自然资源局都依据相关规章制度，对违法占地案件进行了挂牌督办。这些案例中，违法占地行为均涉及未经批准擅自占用土地、占用耕地等严重违法行为，且造成了不良社会影响。自然资源管理部门通过挂牌督办的方式，对这些案件进行了严肃处理，并公开通报了处理结果，起到了良好的警示作用。

综上所述，挂牌督办违法占地案件的依据主要来源于法律法规、部门规章与规范性文件以及违法行为的严重性、社会关注度和典型性等方面。在实际操作中，自然资源管理部门会依据这些依据对违法占地案件进行挂牌督办，以维护自然资源管理秩序和社会稳定。