地方政府在查处土地违法案件时，主要依据的是一系列与土地管理相关的法律法规。以下是一些关键的法律依据及其详细解释：

首先，《中华人民共和国土地管理法》是查处土地违法案件的核心法律。该法第七十六条和第七十七条明确规定了非法占用土地的处罚措施。具体来说：

• 第七十六条指出，未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的，由县级以上人民政府土地行政主管部门（现通常为自然资源主管部门）责令退还非法占用的土地。对于违反土地利用总体规划，擅自将农用地改为建设用地的，会限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，并恢复土地原状。如果符合土地利用总体规划，则会没收在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，并可以并处罚款。

• 第七十七条进一步强调了未经批准或骗取批准非法占用土地的严重性，并规定了相应的处罚措施，包括责令退还土地、拆除或没收建筑物和设施、罚款，以及对直接负责的主管人员和其他直接责任人员的处分。如果构成犯罪，还会依法追究刑事责任。

此外，《中华人民共和国土地管理法实施条例》也为查处土地违法案件提供了具体的实施细则。例如，该条例第五十七条第一款规定了依照《土地管理法》第七十七条处以罚款的具体标准，即罚款额为非法占用土地每平方米100元以上1000元以下。

还有，《违反土地管理规定行为处分办法》也明确了对于非法占用土地行为的责任人员的处分措施，包括警告、记过、记大过、降级、撤职甚至开除等。

综上所述，地方政府在查处土地违法案件时，会依据《中华人民共和国土地管理法》及其实施条例，以及《违反土地管理规定行为处分办法》等相关法律法规，对非法占用土地的行为进行严厉打击和处罚。这些法律法规为地方政府提供了明确的执法依据和处罚标准，确保了土地管理的合法性和有效性。