企业国有资产交易操作规则确实适用于非公开协议转让，但需满足特定条件。以下是对这一问题的详细分析：
一、非公开协议转让的适用范围
行业关键性与重组整合：
- 当涉及主业处于关系国家安全、国民经济命脉的重要行业和关键领域的企业重组整合，且对受让方有特殊要求时，经国资监管机构批准，可以采取非公开协议转让方式。例如，军工、石油、铁路等行业的企业间产权转让就可能适用此方式。
- 同一国家出资企业及其各级控股企业或实际控制企业之间因实施内部重组整合进行的产权转让，经该国家出资企业审议决策后，也可采取非公开协议转让。
增资情形：
- 因国有资本布局结构调整需要，特定的国有及国有控股企业或国有实际控制企业参与增资时，经国资监管机构批准，可采取非公开协议方式进行增资。
- 国家出资企业与特定投资方建立战略合作伙伴或利益共同体时，由该投资方参与国家出资企业或其子企业增资，经审议决策后，同样可采取非公开协议方式。
二、非公开协议转让的条件
控股要求：
- 转让的国有资产如果关系国民经济关键行业，转让后仍需保持国有控股地位，以维护国家战略安全和产业发展需要。
审批程序：
- 符合上述条件之一的转让行为，需按照转让方的隶属关系进行审批。中央企业需由国务院国资委批准，地方企业则由省级国资监管机构批准。
- 审批部门对协议转让持谨慎态度，实践中仍以公开市场交易为原则，协议转让为例外。
价格确定与评估：
- 转让价格不得低于经核准或备案的评估结果。但在某些特定情形下（如同一国家出资企业内部重组整合），经国资监管机构批准后可以不进行评估。
- 国有资产转让应以依法评估的、经履行出资人职责的机构认可或报经本级人民政府核准的价格为依据，合理确定最低转让价格，以防止国有资产损失。
公开、公平、公正原则：
- 协议转让过程必须遵循公开、公平、公正的原则，特别是当关联方（如董事、监事、高级管理人员及其近亲属等）参与受让时，应与其他受让参与者平等竞买，且转让方需如实披露相关信息。
三、其他重要规定
防止国有资产损失：
- 国有资产转让应当有利于国有经济布局和结构的战略性调整，并不得损害交易各方的合法权益。
遵守国家相关规定：
- 特别是当国有资产向境外投资者转让时，还需严格遵守国家有关规定，确保不危害国家安全和社会公共利益。
企业内部转让限制：
- 如果转让行为发生在所出资企业内部，则转让方和受让方应为所出资企业或其全资、绝对控股企业，以保持企业内部管理的稳定性和连续性。
四、法律后果与风险提示
- 法律后果：如果未按照上述规定进行非公开协议转让，可能会面临国资监管机构的处罚，包括但不限于责令改正、没收违法所得、罚款等。同时，转让行为也可能被认定为无效，导致交易各方遭受经济损失。
- 风险提示：在进行非公开协议转让时，务必确保满足所有法定条件，并严格按照审批程序进行。同时，应充分披露相关信息，确保交易过程的公开、公平、公正。如有任何疑问或不确定之处，应及时咨询专业律师或国资监管机构。
综上所述，企业国有资产交易操作规则确实适用于非公开协议转让，但需满足一系列特定条件。在进行此类转让时，务必谨慎行事，确保合法合规。如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。