结论：部分工程完成后三年内付清款项，并不直接等同于建筑工程队全垫资。是否构成全垫资，需根据合同具体条款、双方约定及实际履行情况综合判断。

分析说明：

1. 全垫资的定义与特征：

   • 全垫资通常指的是承包方在工程建设过程中，自行承担全部或大部分资金，包括材料费、人工费等，直至工程完工并交付使用后，才由发包方按照约定支付工程款。
   • 全垫资模式下，承包方承担较大的资金压力和风险，因为工程款的支付往往与工程进度、质量、验收等多个环节挂钩，且可能受到发包方财务状况、市场变化等因素的影响。

2. 部分工程完成后三年内付清款项的性质：

   • 这种支付方式仅说明了工程款的支付时间节点，即部分工程完成后的一定时间内（如三年）付清款项。
   • 它并未直接说明承包方是否需要自行承担全部或大部分资金，也未涉及资金压力和风险的分配问题。

3. 判断是否构成全垫资的关键因素：

   • 合同条款：首先，需要仔细审查合同中的相关条款，特别是关于工程款支付方式、支付时间、支付条件以及双方权利义务的约定。如果合同中明确约定了承包方需自行承担全部或大部分资金，且发包方在工程完工后的一定时间内支付工程款，那么可能构成全垫资。
   • 双方约定：除了合同条款外，双方在实际履行过程中的约定和协商也是判断是否构成全垫资的重要依据。如果双方在实际履行过程中形成了新的约定或协商结果，且这些约定或结果与合同条款不一致，那么应以实际履行过程中的约定为准。
   • 实际履行情况：最后，还需要考虑实际履行情况。如果承包方在实际履行过程中确实自行承担了全部或大部分资金，且发包方未按照约定支付工程款，那么可能构成全垫资。反之，如果承包方并未自行承担全部或大部分资金，或者发包方已经按照约定支付了部分或全部工程款，那么则不构成全垫资。

法律建议：

• 对于承包方而言，在签订合同时应明确约定工程款的支付方式、支付时间、支付条件以及双方权利义务等条款，以避免因约定不明而产生的纠纷。同时，在实际履行过程中应保留好相关证据，如合同、发票、付款凭证等，以便在发生纠纷时能够证明自己的主张。
• 对于发包方而言，应按照合同约定及时支付工程款，避免因拖欠工程款而引发的法律纠纷。同时，在签订合同时也应仔细审查合同条款，确保自己的权益得到充分保障。

可能后果：

• 如果构成全垫资且发包方未按照约定支付工程款，承包方可能面临资金压力、利息损失等风险，并有权通过法律途径追究发包方的违约责任。
• 如果不构成全垫资或双方对是否构成全垫资存在争议，那么可能需要通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决纠纷。在此过程中，双方应积极配合并提供相关证据以支持自己的主张。