结论：您作为当事人，在二次“百吨王”（通常指严重超载的货运车辆）时隔五六年被交警立案为刑事案件的情况下，是有权提出申诉的。但申诉的成功与否以及具体流程，需结合案件具体情况和法律规定来综合判断。
法律背景与建议：
申诉的法律依据：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，当事人及其法定代理人、近亲属，对已经发生法律效力的判决、裁定，可以向人民法院或者人民检察院提出申诉，但是不能停止判决、裁定的执行。虽然您的案件可能尚未进入判决阶段，但申诉作为当事人的一项权利，在案件处理过程中同样可以行使，尤其是当您认为案件处理存在错误或不当之处时。
申诉的时机与条件：
- 申诉通常应在案件处理过程中或判决生效后提出。在您的案例中，由于案件已被交警立案为刑事案件，您可以在案件处理过程中，如侦查阶段、审查起诉阶段或审判阶段，向相应的司法机关提出申诉或异议。
- 申诉应基于合理的理由，如证据不足、事实认定错误、法律适用不当等。您需要准备充分的证据和理由来支持您的申诉请求。
申诉的具体流程：
- 侦查阶段：如果您认为交警的立案决定存在错误，可以向公安机关的上级部门或同级人民检察院提出申诉，要求撤销案件或重新调查。
- 审查起诉阶段：案件移送至人民检察院后，您可以向人民检察院提出申诉，要求人民检察院对案件进行审查并作出相应的决定。
- 审判阶段：如果案件已经进入法院审判阶段，您可以在庭审过程中提出异议，或者在判决后向上一级人民法院提出上诉或申诉。
申诉的注意事项：
- 时效性：虽然刑事案件的申诉没有严格的时效限制，但尽早提出申诉有助于及时纠正错误，避免案件进一步恶化。
- 证据准备：申诉时应准备充分的证据来支持您的观点，如监控录像、证人证言、鉴定意见等。
- 法律程序：遵循法律程序进行申诉，避免采取非法手段或途径来解决问题。
可能的法律后果：
- 如果申诉成功，案件可能会被撤销、重新调查或改判，从而维护您的合法权益。
- 如果申诉失败，案件将继续按照原程序进行，您需要接受相应的法律后果。但失败并不意味着您没有其他救济途径，您仍然可以在后续的法律程序中继续维护自己的权益。
进一步思考：
- 在提出申诉前，建议您先咨询专业律师（虽然这里我作为徐海燕律师已经给出了初步建议，但具体案件仍需具体分析），对案件进行全面评估，了解申诉的可行性和风险。
- 申诉过程中，保持与司法机关的沟通，及时了解案件进展，并根据情况调整申诉策略。
- 无论申诉结果如何，都应尊重法律程序，依法维护自己的权益。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。