关于离职证明是否需要放在档案里，这个问题其实并没有一个绝对的答案，因为它可能因不同的单位、地区或具体政策而有所差异。不过，我可以根据一般情况和常见做法来给您详细解释一下。

首先，离职证明的作用： 离职证明是员工与原单位解除劳动关系后，由原单位出具的一份书面证明。它通常包含了员工的姓名、身份证号码、入职和离职日期、工作岗位以及离职原因等信息。这份证明对于员工来说非常重要，因为它不仅是员工与原单位劳动关系结束的正式确认，也是员工在新单位入职时可能需要提供的重要材料之一。

其次，关于离职证明是否需要放入档案：

1. 一般情况：

   • 在很多情况下，离职证明并不直接作为档案材料的一部分进行归档。档案通常包含了员工的个人基本信息、学历证明、工作经历、奖惩记录等更为全面和长期的信息。
   • 离职证明更多地是在员工需要证明其与原单位劳动关系已经解除时，作为一份临时性的、针对特定目的（如新单位入职）的材料来使用。

2. 特殊情况：

   • 然而，也有一些单位或地区可能要求将离职证明作为档案材料的一部分进行归档。这通常是为了确保员工工作经历的完整性和连续性，或者出于某种特定的管理需要。
   • 如果您的新单位在查看您的档案时发现缺少离职证明，并要求您提供，那么这很可能是该单位的具体要求或政策。在这种情况下，您应该按照新单位的要求提供离职证明。

3. 实际操作建议：

   • 当您离职时，最好向原单位索取多份离职证明原件，以备不时之需。
   • 如果新单位要求将离职证明放入档案，而您已经将离职证明用于其他目的（如第二家单位的入职资料），您可以尝试与第二家单位协商，看是否能够提供复印件或加盖公章的证明文件作为替代。
   • 如果协商无果，您可能需要联系原单位重新出具离职证明，或者根据新单位的要求提供其他能够证明您与原单位劳动关系已经解除的材料。

最后，关于您提到的具体案例： 如果您的新单位在查看档案时发现缺少第一家公司的离职证明，并要求您提供原件，而这份离职证明已经在第二家单位的入职资料里，且第二家公司拒绝提供原件，那么您可以尝试上述建议中的方法与第二家公司协商或联系原单位重新出具离职证明。

总之，离职证明是否需要放入档案并没有一个固定的答案，它取决于具体单位、地区或政策的要求。在处理这类问题时，建议您根据实际情况和具体要求来灵活应对。