您家的合法房屋被政府部门强拆，您有权通过法律途径维护自身合法权益，具体可按以下步骤处理：

1. 立即固定证据

   • 现场取证：对强拆现场进行拍照、录像，重点记录房屋原状、强拆过程、参与人员及车辆信息（如制服标识、车牌号等）。
     
   • 保存文件：留存房屋产权证、土地使用证、规划许可证等权属证明原件及复印件；若曾收到政府文件（如征收决定、限期拆除通知等），需完整保存。
     
   • 证人证言：联系现场目击者（如邻居、路人）出具书面证言，并留存其联系方式。

2. 确认强拆主体与程序合法性

   • 主体资格：根据《行政强制法》第17条，强拆主体应为县级以上政府或其委托的部门（如城管局、街道办）。若为开发商、村委会等非行政主体实施，可能涉嫌违法犯罪，需立即报警并追究其责任。
     
   • 程序审查：政府强拆需满足以下程序：
     
     • 作出征收补偿决定或限期拆除决定；
       
     • 催告当事人履行义务；
       
     • 作出强制执行决定并送达；
       
     • 公告强制执行时间、方式。
       若政府未履行上述程序，强拆行为即属违法。

3. 申请行政复议或提起行政诉讼

   • 复议期限：自知道强拆行为之日起60日内，向上一级政府或作出决定的部门申请行政复议，要求撤销强拆决定或确认违法。
     
   • 诉讼期限：自知道强拆行为之日起6个月内，向法院提起行政诉讼，主张赔偿损失（包括房屋价值、屋内物品损失、临时安置费等）。
     建议优先选择诉讼，因复议结果可能维持原决定，而诉讼可直接审查强拆合法性并主张赔偿。

4. 申请国家赔偿

   • 条件：若法院确认强拆行为违法，您可在判决生效后2年内，向赔偿义务机关（实施强拆的政府）提出国家赔偿申请，要求赔偿房屋损失、屋内物品损失及精神损害抚慰金。
     
   • 证据要求：需提供房屋价值评估报告、物品清单及价值证明（如购买发票）、强拆导致的人身伤害证明等。

5. 刑事控告（如涉及）

   • 若强拆过程中存在故意毁坏财物、非法侵入住宅、暴力殴打等行为，可向公安机关报案，追究相关人员刑事责任。

行动建议：

• 尽快委托律师介入，律师可协助调查取证、分析政府文件合法性、制定诉讼策略，并代表您与政府协商赔偿。
  
• 避免与强拆人员发生直接冲突，防止人身伤害或被以“妨碍公务”为由追究责任。
  

法律依据：

• 《行政强制法》第35-44条（行政强制执行程序）
  
• 《国家赔偿法》第4条（行政赔偿范围）
  
• 《行政诉讼法》第12条（行政诉讼受案范围）
  

如有进一步疑问或需协助，可直接向我咨询，我将结合具体证据为您分析案件走向。