双方协商支付给乙方的法律依据主要来源于《中华人民共和国民法典》中关于合同的相关规定。以下从不同角度为您详细分析：
合同自由原则：
- 法律依据：根据《民法典》第四百六十四条，合同是民事主体之间设立、变更、终止民事法律关系的协议。这意味着，双方有权在平等、自愿的基础上，通过协商确定合同的内容，包括支付条款。
- 分析：在合同自由原则下，双方可以就支付金额、支付方式、支付时间等关键条款进行协商，并达成一致意见。这种协商支付的方式，只要不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，就是合法有效的。
合同成立与生效：
- 法律依据：根据《民法典》第四百八十三条，承诺生效时合同成立。同时，根据《民法典》第五百零二条，依法成立的合同，自成立时生效，但是法律另有规定或者当事人另有约定的除外。
- 分析：双方协商支付给乙方的条款，作为合同的一部分，在双方达成一致意见并签署合同后，即成为合同的有效内容。只要合同本身合法有效，那么协商支付的条款也具有法律效力，双方应当按照约定履行。
支付条款的具体规定：
- 法律依据：虽然《民法典》没有直接规定协商支付的具体条款，但根据《民法典》第五百七十七条，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
- 分析：这意味着，如果双方在合同中明确约定了协商支付的条款，如支付金额、支付时间等，那么任何一方违反这些条款，都可能构成违约，需要承担相应的法律责任。因此，在协商支付时，双方应当明确、具体地约定支付条款，以避免后续纠纷。
实际操作建议：
- 在协商支付时，建议双方采用书面形式记录协商内容，并作为合同的附件或补充协议，以确保双方的权利和义务得到明确保障。
- 双方在协商支付时，应当充分考虑各种可能的风险因素，如支付能力、支付时间等，并制定相应的风险应对措施。
- 如果双方在协商支付过程中出现分歧或争议，建议及时寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自身合法权益。
总结来说，双方协商支付给乙方的法律依据主要来源于《民法典》中关于合同自由原则、合同成立与生效以及支付条款的相关规定。在实际操作中，双方应当明确、具体地约定支付条款，并采用书面形式记录协商内容，以确保双方的权利和义务得到明确保障。如果您在协商支付过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。