行政处罚赔偿撤案后，通常不会在官方的记录中留下案底，即该处罚决定在法律上视为从未存在过，但具体影响还需从多个角度进行分析：
一、对行政相对人的直接影响
权益恢复：
- 一旦行政处罚被撤销，行政相对人因处罚而受限或剥夺的合法权益将得以恢复。例如，若企业因错误的行政处罚被吊销营业执照，撤案后其营业执照将恢复正常，企业可以重新开展经营活动。
经济损失赔偿：
- 若行政相对人因错误处罚遭受直接经济损失，有权依据《中华人民共和国国家赔偿法》要求行政机关进行赔偿。这包括罚款的退还及相应利息，以及因查封、扣押等强制措施导致的实际损失。撤案后，行政机关应积极履行赔偿义务，以弥补行政相对人的经济损失。
消除不良影响：
- 行政机关应负责采取适当方式，如原公告范围内发布撤销处罚的公告，以消除对行政相对人的不良声誉影响，恢复其名誉。这有助于行政相对人在社会活动中重新获得信任和尊重。
二、对行政机关的法律责任与后续行动
行政行为效力丧失：
- 自撤销之日起，原行政处罚决定失去法律效力。行政机关不得再基于此处罚决定采取任何进一步措施，也不得将其作为行政管理依据。这确保了行政行为的合法性和有效性，维护了行政相对人的合法权益。
重新作出行政行为的规范：
- 若相关管理事项仍需处理，行政机关需重新调查、取证，并基于正确的事实与法律规定重新作出行政行为。但需注意的是，新行为不能基于同一事实和理由作出与原处罚相同或基本相同的处罚，除非主要事实或理由已发生改变。这防止了行政机关滥用职权，保护了行政相对人的合法权益。
内部责任追究与公信力修复：
- 行政处罚撤销可能揭示执法中的问题，如程序违法、事实认定错误等，导致内部责任追究，包括批评教育、行政处分等。这有助于提升执法水平，防止类似问题再次发生。同时，行政机关需加强自身建设，通过改进执法工作来重塑公众信任，减少公信力受损。
三、对记录与信息系统的影响
官方记录：
- 行政处罚撤销后，通常不会在官方的记录（如犯罪记录、信用记录等）中留下案底。即该处罚决定在法律上视为从未存在过，不会对行政相对人的未来生活和工作产生负面影响。
档案材料保留：
- 尽管处罚决定被撤销，但执法机关在作出行政处罚决定过程中形成的一系列工作档案和记录，如调查笔录、相关证据材料的收集整理等，通常会作为执法工作的一部分被存档保存。这些档案的保留是为了确保整个执法流程的完整性和可追溯性，以及备查和监督行政机关的决策过程是否合法合规。
信息系统记录：
- 在许多地区，行政处罚信息会被录入到行政处罚信息公示系统或信用信息共享平台等信息系统中。即便处罚被撤销，相关记录也可能不会立即删除。这是因为系统的操作流程和数据管理规范要求严谨，删除记录需要严格的审批和操作流程。同时，保留记录可以在一定程度上反映该事件处理的整个过程和结果变化。但行政相对人可以要求相关部门对记录作出标注说明处罚已被撤销，以避免可能产生的误解。
总结与建议：
行政处罚赔偿撤案后，虽然官方的记录中通常不会留下案底，但相关的档案材料和过程性记录仍可能被保留。这些记录的存在并不会对行政相对人产生不利的法律后果，因为被撤销的处罚决定在法律上视为从未存在过。然而，为了确保自身权益不受损害，行政相对人可以要求相关部门对记录作出标注说明处罚已被撤销。如果您在行政处罚赔偿撤案后遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。