针对您提出的“种子店销售劣种子怎么处罚”的问题，这确实是一个涉及农业生产安全和农民权益的重要议题。销售劣种子不仅违反了我国相关法律法规，还可能对农业生产造成严重影响，因此，法律对此类行为有明确的处罚规定。以下是从民事、行政和刑事三个层面对此问题的详细解答：
一、民事责任
- 赔偿损失：
- 根据《中华人民共和国种子法》的相关规定，如果种子使用者因种子质量问题或标签、使用说明标注不真实而遭受损失，他们有权向出售种子的经营者要求赔偿。
- 赔偿范围包括购种价款、可得利益损失（即因种植劣种子而减少的预期收益）以及其他相关损失。
- 如果损失是由种子生产者或其他经营者造成的，出售种子的经营者在赔偿后有权向责任方追偿；反之亦然。
二、行政责任
没收违法所得与罚款：
- 种子店如果销售劣种子，将面临没收违法所得和劣种子的处罚。
- 罚款的金额根据违法生产经营的货值金额来确定。如果货值金额不足一万元，将处以五千元以上五万元以下的罚款；如果货值金额超过一万元，将处以货值金额五倍以上十倍以下的罚款。
吊销许可证：
- 对于情节严重的违法行为，如多次违法被查处或货值金额较大，相关部门可以吊销种子店的种子生产经营许可证，即取消其从事种子生产经营活动的资格。
其他行政处罚：
- 除了上述处罚外，相关部门还可以根据具体情况采取警告、责令停产停业等其他行政处罚措施。
三、刑事责任
构成犯罪的条件：
- 如果销售劣种子的行为导致农业生产遭受重大损失，可能构成生产、销售伪劣种子罪。
量刑标准：
- 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，如果使生产遭受较大损失（一般起点为二万元），将处以三年以下有期徒刑或拘役，并处或单处销售金额百分之五十以上二倍以下罚金。
- 如果使生产遭受重大损失（一般起点为十万元），将处以三年以上七年以下有期徒刑，并处销售金额百分之五十以上二倍以下罚金。
- 如果使生产遭受特别重大损失（一般起点为五十万元），将处以七年以上有期徒刑或无期徒刑，并处销售金额百分之五十以上二倍以下罚金或没收财产。
实际指导意义：
- 对于种子店经营者来说，必须严格遵守相关法律法规，确保所售种子的质量和真实性，以避免承担法律责任。
- 消费者在购买种子时，应选择正规渠道和有信誉的商家，仔细核对种子标签信息，以降低购买到劣种子的风险。
- 农业农村、林业草原等主管部门应加强监管力度，严厉打击销售劣种子的违法行为，保护农业生产者和消费者的合法权益。
综上所述，种子店销售劣种子将面临民事、行政和刑事三方面的法律责任。因此，种子店经营者必须严格遵守法律法规，确保种子质量，以维护农业生产安全和农民权益。