当遇到刑事案件暂时查不出来的情况时，司法机关会依据法律规定和案件具体情况，采取一系列措施来推进案件的侦破和处理。以下是对这一问题的详细解答：
一、侦查阶段
继续侦查：
- 公安机关会持续进行侦查工作，不会因为案件中没有明确嫌疑人或嫌疑人尚未归案就停止。他们会通过现场勘查、询问证人、调取监控录像等多种手段，甚至利用大数据分析等技术来辅助侦查。
补充侦查：
- 如果公安机关在初次侦查中无法收集到足够的证据，他们会进行补充侦查，这通常以两次为限。在审查起诉阶段，检察院也有权要求公安机关补充侦查，或者自行进行补充侦查。
- 如果经过补充侦查后，证据仍然不足，司法机关会根据情况作出不予立案、撤案或存疑不起诉的决定。
变更强制措施：
- 如果犯罪嫌疑人已经被采取了强制措施，但侦查工作没有重大进展，且羁押期限即将届满，公安机关可能会变更强制措施，如取保候审或监视居住。
通缉措施：
- 如果已经确定了嫌疑人的身份，但嫌疑人尚未归案，公安机关会采取通缉措施，公开嫌疑人的信息和罪行，动员社会力量协助抓捕。
二、审查起诉阶段
- 存疑不起诉：
- 如果经过两次补充侦查后，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件，他们会作出存疑不起诉的决定。
- 如果被不起诉人在押，应立即释放。但这并不意味着案件终结，如果发现新的证据，可以重新提起公诉。
三、审判阶段
- 证据不足宣告无罪：
- 在审判过程中，如果公诉机关提供的证据不足以证明被告人有罪，法院会作出无罪判决。
四、其他处理措施
作为积案处理：
- 如果公民报案后，公安机关在一年内无法查清案件，该案件将作为积案处理，待有线索时再恢复侦查。
- 如果积案超过了法律追究时效，即使后来发现了犯罪嫌疑人，也不再追究其法律责任。
告知当事人提起诉讼：
- 对于某些治安案件，如果公安机关在规定时间内无法查清事实，他们会结合具体情况作出处理。
- 如果案件的基本事实清楚、证据确实充分，公安机关会告知受害人向人民法院提起诉讼，要求对方承担民事责任。
监督侦查行为：
- 如果当事人认为公安机关不立案或不积极侦查，他们可以向人民检察院提出申请，要求进行立案监督。
- 如果人民检察院认为公安机关不立案的理由不能成立，他们会通知公安机关立案。控告人还可以申请上级机关进行复议。
总结与建议：
当遇到刑事案件暂时查不出来的情况时，司法机关会依法采取多种措施来推进案件的侦破和处理。作为当事人，您应了解相关法律规定和权益保障途径，如监督侦查行为、申请立案监督等，以便有效参与和监督案件处理过程。同时，保持耐心和信心，相信司法机关会依法公正处理案件。