投标保证金以本票形式提交的，退款流程需根据本票的性质及招标文件的具体要求操作，通常包括以下两种情形：

1. 本票未兑付且未超过有效期
   若本票尚未被招标方兑付且仍在有效期内（通常为出票日起2个月），投标人可直接向招标方提交书面退款申请，附上本票原件及招标文件要求的退款材料（如投标文件收据、未中标通知书等）。招标方审核通过后，应将本票退还投标人，或按约定方式（如背书转让）处理。
   法律依据：根据《票据法》第73条，本票是出票人签发的，承诺自己在见票时无条件支付确定金额的票据。若未兑付，出票人（招标方）仍负有付款义务或退票义务。

2. 本票已兑付或超过有效期

   • 已兑付情形：若招标方已兑付本票，退款需通过银行转账完成。投标人需向招标方提供收款账户信息，招标方应在中标通知书发出后5日内（或招标文件约定期限）退还保证金及银行同期存款利息。
     
   • 超过有效期情形：若本票超过有效期，需先由出票人（招标方）出具拒付证明，投标人持拒付证明及本票原件向其开户银行申请退票，再依据招标文件要求向招标方主张退款。
     法律依据：根据《招标投标法实施条例》第57条，招标人最迟应在书面合同签订后5日内退还投标保证金及利息。若因本票失效导致退款延迟，招标方可能需承担逾期退还的违约责任。

操作建议：

1. 优先查阅招标文件中关于保证金退还的条款，明确退款方式、期限及所需材料；
   
2. 若招标方拖延退款，可书面催告并留存证据，必要时向行政监督部门投诉或提起民事诉讼；
   
3. 涉及本票操作时，建议同步咨询银行票据业务专员，确保流程符合《票据法》及银行规范。
   

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节或法律风险。