镇政府是否有权作为甲方处理土地，需分情况讨论：

1. 集体土地所有权与使用权流转
   根据《土地管理法》第十一条，农民集体所有的土地依法属于村农民集体所有的，由村集体经济组织或者村民委员会经营、管理。若镇政府作为土地所有权人（如镇办企业用地或历史遗留的镇属集体土地），可依法作为甲方签订土地流转协议。但需注意：

   • 流转用途必须符合土地利用总体规划（如不得将农用地转为建设用地未经审批）；
     
   • 需经村民会议三分之二以上成员或三分之二以上村民代表同意（涉及承包地流转时）；
     
   • 流转期限不得超过承包期的剩余期限（如耕地承包期为30年）。

2. 土地征收与补偿协议
   若镇政府受县级以上政府委托实施土地征收，可作为甲方签订补偿协议，但需满足：

   • 征收已获省级政府或国务院批准（《土地管理法》第四十六条）；
     
   • 补偿标准符合《土地管理法》第四十八条规定的“区片综合地价”，且已足额支付；
     
   • 协议内容包含安置方式、社会保障等必备条款。
     例外：若镇政府未经授权擅自征收，协议可能因主体不适格被认定无效。

3. 宅基地使用权处置
   宅基地属农民集体所有，镇政府无权直接作为甲方处置宅基地使用权。但以下情形例外：

   • 宅基地因公共利益需要被征收（需履行法定程序）；
     
   • 宅基地使用权人自愿有偿退出，镇政府作为集体经济组织代表签订协议（需符合地方试点政策，如浙江德清模式）。

4. 行政协议与民事协议的区分

   • 若镇政府以行政管理目的签订协议（如土地复垦协议、违法用地整改协议），属行政协议，适用《行政协议司法解释》；
     
   • 若以平等民事主体身份签订（如土地租赁协议），属民事合同，适用《民法典》合同编。
     关键点：协议中镇政府是否行使行政权力（如单方变更、解除权）。

法律建议：

• 若您是土地权利人，签订协议前需核查镇政府权限（如要求出示批准文件、授权委托书）；
  
• 若协议涉及征收，可要求公示“一书四方案”（建设项目用地呈报说明书、农用地转用方案等）；
  
• 发现镇政府越权处置土地，可向县级自然资源部门举报或提起行政诉讼。
  

后续行动参考：
如需进一步分析协议效力或维权策略，请提供协议文本关键条款（如土地用途、签约主体、审批文件等），我将结合具体条款为您制定应对方案。