协议上既可以盖合同章，也可以盖公章，两者均具备法律效力，但具体选择需根据公司规定和实际情况来决定。以下是对此问题的详细分析：
一、公章与合同章的法律效力
公章：
- 公章是法人权利的象征，代表着公司的整体意志和最高权威。
- 加盖公章的协议或其他文件，表明该内容是公司正式、官方的意思表示，具有极高的法律认可度和权威性。
- 公章不仅适用于协议，还适用于公司的重要文件、证明材料等，其适用范围广泛。
合同章：
- 合同章是专门用于签订合同的印章，使用范围相对特定。
- 它主要用于公司对外签订的各类合同协议，以突出合同签订行为的专业性和针对性。
- 在一些大型企业或合同签订频繁的环境中，为便于管理和区分，会倾向于使用合同章处理合同事务。
二、选择公章或合同章的考虑因素
公司规定：
- 公司应根据自身习惯和管理规定来决定使用公章还是合同章。规模较小、业务单一的公司可能统一使用公章；而大型企业则可能因管理需要而使用合同章。
- 如果公司对盖章有明确规定，应严格遵守，以避免后续可能出现的法律纠纷或不必要的麻烦。
对方要求：
- 在签订协议前，应确认对方对盖章的要求。如果对方明确要求使用公章或合同章，应按照对方的要求来履行，以确保双方对协议的有效性没有异议。
实际交易情况：
- 在实际交易中，如果双方对盖章没有特定要求，且协议内容真实合法，即使没有盖章，只要双方签字或按指印确认，协议同样可以具有法律效力。但为了确保协议的正式性和权威性，建议还是加盖公章或合同章。
三、注意事项
印章的真实有效性：
- 无论选择公章还是合同章，都必须确保其真实有效。虚假或无效的印章将严重影响协议的法律效力。
- 在使用印章前，应确认印章的合法性和有效性，避免使用被盗用或伪造的印章。
协议内容的合法性：
- 除了盖章外，协议的内容也必须真实合法，且没有违反法律法规的强制性规定。如果协议内容存在违法或违规情况，即使加盖了公章或合同章，协议也可能被认定为无效。
签字与盖章的同等效力：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这意味着签字或按指印与盖章在法律上具有同等的效力。因此，在签订协议时，除了盖章外，也可以考虑签字或按指印的方式。
总结与建议：协议上盖公章或合同章均可，但需根据公司规定和实际情况做出选择。在选择印章时，应确保印章的真实有效性，并遵循相关法律法规和公司规定。同时，也要关注对方对盖章的要求，以确保双方对协议的有效性没有异议。如果在签订协议过程中有任何疑问或担忧，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见和指导。