抵押合同纠纷与抵押权纠纷在法律上存在明显区别，主要体现在纠纷性质、争议焦点及法律适用等方面。以下从多个角度为您详细分析：

1. 纠纷性质不同

• 抵押合同纠纷：属于合同纠纷范畴，主要围绕抵押合同的签订、履行、变更或解除等环节产生的争议。例如，抵押合同是否成立、是否有效、是否履行了登记手续、是否存在欺诈或胁迫等情形。
• 抵押权纠纷：属于物权纠纷范畴，主要围绕抵押权的设立、效力、实现及优先受偿权等产生的争议。例如，抵押权是否依法设立、抵押物是否被非法处置、抵押权与其他债权的关系等。

2. 争议焦点不同

• 抵押合同纠纷：
  • 合同效力问题：如抵押合同是否因违反法律强制性规定而无效。
  • 合同履行问题：如抵押人是否按约定办理了抵押登记。
  • 合同解除问题：如一方违约导致合同解除的条件是否成就。
• 抵押权纠纷：
  • 抵押权设立问题：如抵押权是否因未办理登记而未设立。
  • 抵押权效力问题：如抵押权是否因主债权消灭而消灭。
  • 抵押权实现问题：如抵押物拍卖、变卖后的价款分配顺序。

3. 法律适用不同

• 抵押合同纠纷：主要适用《中华人民共和国民法典》合同编中关于合同成立、效力、履行及违约责任的规定。例如，《民法典》第四百零二条（抵押权的设立）及合同编相关条款。
• 抵押权纠纷：主要适用《中华人民共和国民法典》物权编中关于抵押权设立、效力及实现的规定。例如，《民法典》第三百九十四条（抵押权的定义）、第四百一十条（抵押权的实现）等。

4. 典型案例对比

• 抵押合同纠纷案例：
  • 甲与乙签订借款合同，约定以甲的房屋作为抵押，但未办理抵押登记。后甲未按期还款，乙起诉要求甲履行抵押合同并办理登记。此时，纠纷焦点为抵押合同是否因未登记而影响效力，属于抵押合同纠纷。
• 抵押权纠纷案例：
  • 甲与乙签订借款合同并办理了房屋抵押登记。后甲未按期还款，乙起诉要求拍卖抵押房屋并优先受偿。此时，纠纷焦点为抵押权是否依法设立及乙是否享有优先受偿权，属于抵押权纠纷。

5. 实务建议

• 抵押合同签订时：
  • 确保合同内容合法、明确，避免因条款瑕疵导致合同无效。
  • 及时办理抵押登记，确保抵押权依法设立。
• 纠纷发生时：
  • 区分纠纷性质，选择正确的法律途径解决。例如，合同纠纷可通过协商、诉讼或仲裁解决；物权纠纷则需通过物权确认或实现物权之诉解决。
  • 保留相关证据，如合同文本、登记证明、付款凭证等，以支持己方主张。

总结：抵押合同纠纷与抵押权纠纷虽相关联，但性质、焦点及法律适用均不同。在实务中，需根据具体争议内容选择正确的法律路径。如有进一步疑问，可直接向我咨询，我将结合具体案情为您提供专业分析。